Геномы всех пингвинов: масштабный проект завершён

Консорциум Penguin Genome Consortium отсеквенировал геномы всех ныне живущих видов пингвинов, чтобы понять эволюцию жизни во льдах. Результаты опубликованы в журнале GigaScience.

О проекте

Консорциум, объединивший учёных из Китая, Дании, Новой Зеландии, Австралии, Аргентины, ЮАР, Великобритании, США, Франции и Германии, представил 19 высококачественных геномных последовательностей. Вместе с двумя ранее опубликованными они охватывают все сохранившиеся виды пингвинов. Это беспрецедентный объём информации для целого биологического отряда.

Значение пингвинов как индикаторов

Пингвины, обитающие по всему Южному полушарию — от экваториальных Галапагосских островов до морских льдов Антарктики, — являются важным индикатором изменений. Многие популяции стремительно сокращаются: например, численность королевских пингвинов упала на 88% всего за три десятилетия. Сокращение связывают с изменением климата, деградацией среды, рыболовством, загрязнением и интродукцией хищников.

Тереза Коул (Университет Отаго, Новая Зеландия): "История популяций разных видов записана в их геноме. Это поможет предсказать тренды в условиях будущих климатических изменений и разработать стратегии сохранения".

Эволюционный аспект

Изучение радиации 20 видов пингвинов — уникальный случай для исследования их морфологических и физиологических адаптаций. Консорциум также секвенирует геномы недавно вымерших таксонов.

Гоцзе Чжан (Университет Копенгагена, BGI, Куньминский институт зоологии): "Предок пингвинов пережил быструю радиацию, приведшую к нынешним ~20 видам. Это отличная модель для изучения видообразования".

Культурный и логистический контекст

Помимо логистических трудностей сбора образцов из удалённых уголков планеты, проект столкнулся с культурными аспектами. В Новой Зеландии пингвины считаются таонга (сокровищами) культуры маори, что потребовало тщательных консультаций с indigenous-сообществами.

Брюс МакКинли (Департамент охраны природы Новой Зеландии): "Мы провели строгие консультации, чтобы секвенировать геномы шести видов-таонга. Эти геномы важны и в культурном контексте".

Первые результаты и доступ к данным

Первоначальной целью было создание высококачественных геномов. Уже первые данные подтвердили их ценность: построенное филогенетическое дерево показывает, что пингвины адаптировались к Антарктике несколько раз независимо.

Данные 19 геномов предоставлены в ранний доступ. Консорциум открыт для новых участников и призывает следовать правилам Форт-Лодердейла и Торонто при использовании данных для межвидовых сравнений.