Хранение почвенных образцов в холодильнике или на воздухе сохраняет важные микробные данные

Исследователи из Университета Теннесси в Ноксвилле, Джо Эдвардс и Сара Лав, установили, что почвенные образцы, хранящиеся в охлаждённом или высушенном на воздухе состоянии, по-прежнему сохраняют информацию, необходимую для понимания состава и структуры микробных сообществ в течение многих лет. Результаты опубликованы в журнале Soil Biology and Biochemistry.

Традиционно для сохранения ДНК микробов образцы почвы замораживали. Новое исследование показывает, что менее энергозатратные методы — охлаждение или сушка на воздухе — также эффективны для долгосрочных исследований.

Ключевые выводы:

• Высушенные на воздухе почвы полезны для изучения пространственных закономерностей в сообществах грибов в континентальном масштабе.
• Архивы высушенных почв позволяют отслеживать экологические изменения на микробном уровне за длительные периоды, потенциально до нескольких десятилетий.
• Метод особенно надёжен для анализа общих закономерностей в разнообразии и составе сообществ, но менее точен для отслеживания конкретных таксонов грибов.

Это открытие позволяет использовать существующие национальные базы данных архивных образцов почвы для ретроспективного изучения исторических изменений микробиомов с помощью современных методов секвенирования, которые существуют всего 10–15 лет.

Полученные данные будут применены в следующем этапе исследования: секвенировании тысяч высушенных на воздухе образцов почвы со всей страны для понимания долгосрочных глобальных закономерностей изменений.