Проект 100K Pathogen Genome Project представил первые секвенированные геномы

Проект 100K Pathogen Genome Project в Калифорнийском университете в Дэвисе объявил о секвенировании геномов первых 10 патогенных микроорганизмов, включая штаммы Salmonella и Listeria.

Цель проекта — создание бесплатной онлайн-энциклопедии или референсной базы данных геномов. Это позволит во время вспышек пищевых заболеваний быстро идентифицировать ответственный микроорганизм и отследить его источник в пищевой цепи с помощью автоматизированных методов обработки информации.

По оценке директора проекта профессора Барта Веймера, наличие этой геномной информации сократит вдвое время, необходимое для диагностики и лечения пищевых заболеваний, и позволит учёным делать открытия для разработки новых методов контроля болезнетворных микроорганизмов.

Проект посвящён секвенированию геномов 100 000 бактерий и вирусов, вызывающих серьёзные пищевые заболевания по всему миру. Только в США, по данным Центров по контролю и профилактике заболеваний, ежегодно от болезней пищевого происхождения страдает 48 миллионов человек, а умирает 3 000.

Первые 10 последовательностей геномов — это начало серии данных, которые проект будет размещать в общедоступной базе данных Национального центра биотехнологической информации Национальных институтов здравоохранения (NCBI/NIH). По словам Веймера, этот первоначальный выпуск подтверждает всю рабочую цепочку: от получения бактерии до производства последовательности генома и автоматической публикации.

В настоящее время проект секвенирует второй набор из 1500 микробных геномов, ожидаемый к выпуску осенью 2013 года.