Учёные создали крупнейший набор данных по протеомике развития для любого животного

Исследователи из Университета Нотр-Дам создали самый большой набор данных по протеомике развития для любого организма, отследив динамику экспрессии белков у эмбрионов африканской шпорцевой лягушки (Xenopus laevis).

Ключевые достижения:

• Идентифицировано и измерено количество около 4000 белков на ранних стадиях развития эмбриона, начиная с одноклеточной зиготы.
• Установлены паттерны экспрессии белков, отражающие ключевые события развития, например, появление органо- и тканеспецифичных белков (в клетках сердечной мышцы) перед анатомическими изменениями.
• Исследование может помочь понять причины врождённых пороков развития из-за нарушения регуляции экспрессии генов.

Неожиданное открытие:

Работа выявила неожиданно высокий уровень несоответствия между уровнями матричной РНК (mRNA), кодирующей белки, и уровнями соответствующих белков. Это противоречит распространённому предположению о прямой связи и показывает, что количество белка контролируется множеством механизмов.

Модельный организм:

Xenopus laevis — удобная модель для изучения развития, так как эмбриогенез проходит вне матери в чётко определённых стадиях, его легко наблюдать в реальном времени, а эмбрионы быстро развиваются (за 4 дня формируется почти полноценная нервная система). Это позволяет моделировать различные патологические состояния.

Исследование опубликовано в журнале Scientific Reports в статье "Quantitative proteomics of Xenopus laevis embryos: expression kinetics of nearly 4000 proteins during early development".