Новый инструмент для расшифровки эволюционной биологии

Понимание эволюции — один из краеугольных камней биологии. Популярный подход к её изучению — сравнение данных генома с помощью компьютерных биоинформатических инструментов, которые анализируют эволюцию отдельных белков. Эти инструменты предполагали, что скорость эволюции разных регионов белка можно смоделировать статистическим распределением, форма которого определяется одной переменной.

Однако, как объясняет Минь Куанг Буй из Центра интегративной биоинформатики (CIBIV), это предположение не отражает реальность и могло привести к публикации большого количества смещённых филогенетических результатов за последние два десятилетия.

Новый алгоритм позволяет получить представление об эволюции белков

Арндт фон Хезелер из лабораторий Макса Ф. Перуца (MFPL) и Ларс Йермин из Австралийского национального университета разработали революционный способ внедрения различных скоростей эволюции в биоинформатические модели.

Хотя среди экспертов было известно, что популярный подход может не улавливать сложности эволюции белков, вычислительная стоимость использования более реалистичных моделей была неприемлемо высокой. «Мы разработали быстрый алгоритм, который даёт нам ранее недоступное представление об эволюции белков. Этот новый инструмент, вероятно, окажет огромное влияние на широкий спектр областей исследований, включая эволюцию патогенов и распространение сельскохозяйственных вредителей», — говорит Йермин.

Новая программа ModelFinder позволит получить более точные научные оценки эволюционных процессов и поможет на шаг приблизиться к разгадке тайн, ответственных за великое разнообразие жизни на нашей планете.