Новый коронавирус (SARS-CoV-2) картирован
Исследовательская группа Центра исследований РНК Института фундаментальных наук (IBS, Южная Корея) под руководством профессоров Ким В. Нарри и Чан Хесика в сотрудничестве с Корейским национальным институтом здравоохранения (KNIH) экспериментально определила архитектуру РНК-генома SARS-CoV-2.
Ключевые результаты:
- Подтверждено существование 9 субгеномных РНК, которые транслируются в вирусные белки (спайки, оболочку и др.). Одна из 10 ранее предсказанных РНК не обнаружена.
- Обнаружены десятки неизвестных субгеномных РНК, образовавшихся в результате событий слияния и делеции. Это может способствовать относительно быстрой эволюции коронавируса.
- Выявлены множественные неизвестные химические модификации на вирусных РНК. Они могут помогать вирусу избегать атаки иммунной системы хозяина.
- Создана высокодетальная карта расположения генов на геномной РНК и всех вирусных РНК (транскриптом) с модификациями (эпитранскриптом).
Методология: Успех исследования основан на комбинации двух методов секвенирования:
- Нанопоровое прямое секвенирование РНК — для анализа длинных целых молекул вирусной РНК без фрагментации.
- Секвенирование ДНК-наноболов — для высокоточного анализа большого количества коротких фрагментов.
Значение: Полученная карта поможет понять, как вирус реплицируется и уклоняется от иммунной системы. Изучение функций новых генов, механизмов слияния и роли РНК-модификаций может внести вклад в разработку более эффективных диагностических средств и терапевтических препаратов.