Первое исследование микробиоты слюны поросят после отъёма

Бактерии типов Firmicutes и Proteobacteria, включая род Streptococcus, являются наиболее распространёнными микроорганизмами в слюне свиней. Её микробиота отличается от микробиоты фекалий животных и окружающей их среды.

Таковы результаты первого в своём роде исследования, проведённого учёными из Университета Сан-Паулу (Бразилия) и Университета штата Пенсильвания (США). Они впервые охарактеризовали микробный состав ротовой жидкости, фекалий и среды обитания поросят в коммерческих хозяйствах Бразилии. Статья опубликована в Scientific Reports.

Методы и объекты исследования

• Исследователи проанализировали ротовую жидкость (смесь слюны и мукозного транссудата) у 50 отъёмышей с пяти коммерческих ферм в штате Сан-Паулу. Выбор этой возрастной группы не случаен: отъём — стрессовый период, связанный с изменением диеты и микробиоты.
• Бактериальный состав образцов ротовой жидкости, фекалий и с поверхности пола станков определяли с помощью секвенирования гена 16S рРНК и анализировали в R Studio.

Ключевые результаты

• В ротовой жидкости доминировали бактерии типов Firmicutes (80,4%) и Proteobacteria (7,7%). Роды Streptococcus (Pasteurellaceae) и Veillonella были особенно обильны по сравнению с образцами фекалий.
• В фекалиях и образцах среды наиболее распространёнными типами были Firmicutes, Proteobacteria и Bacteroidota, а наиболее частым родом — Prevotella_9. Их состав был схожим независимо от размера фермы и процедур уборки.
• Альфа-разнообразие (число видов в отдельных образцах) было значительно ниже в образцах ротовой жидкости, чем в фекалиях и образцах с пола.
• Бета-разнообразие (изменчивость видового состава между образцами) показало, что сообщества в фекалиях были ближе к сообществам в образцах среды и дальше от ротовых.

Значение исследования

Понимание микробиоты ротовой жидкости служит основой для исследований микробиома и улучшения здоровья и продуктивности свиней. Это позволяет изучать маркеры здоровья, а также бактерии, связанные с заболеваниями. Результаты открывают возможности для разработки решений, например, пребиотиков.

Следующий шаг — исследование изменений в микробиоме кишечника, поскольку бактерии ротовой полости отличаются от фекальных. Уже начат анализ пяти различных сегментов кишечника у 40 поросят.