Ученые выявили четкие типы вирусов в океане с помощью нового метода

Исследователи из Университета Аризоны под руководством эколога Мэтью Салливана, используя культивированные бактерии в качестве «приманки», секвенировали полные и частичные геномы около 10 миллионов вирусов из одного образца морской воды.

Исследование, опубликованное 14 июля в журнале Nature, показало, что геномы вирусов в природных экосистемах делятся на более четкие категории, чем считалось ранее. Это впервые позволяет ученым идентифицировать реальные популяции вирусов в природе.

Новый метод «вирусного мечения»

Команда разработала подход viral tagging, при котором культивированные бактерии-хозяева используются как «приманка» для «ловли» заражающих их вирусов. Затем ученые выделяют ДНК этих вирусов и расшифровывают их последовательность.

Результаты: 17 четких типов

«Вместо континуума мы обнаружили по меньшей мере 17 различных типов вирусов в одном образце воды Тихого океана, включая несколько новых для науки, — все ассоциированные с единственным хозяином-"приманкой"», — заявил Салливан.

Значение для науки

• Микробы признаны движущей силой биогеохимических процессов Земли, а вирусы, инфицирующие их, контролируют эти процессы.
• Новый метод впервые позволяет сопоставлять вирусы с их хозяевами-микробами в масштабах, релевантных для природы.
• Понимание разнообразия вирусов имеет значение не только для экологии, но и для медицины — например, для разработки вакцин и противовирусной терапии.

Перспективы

«Впервые мы можем подсчитывать типы вирусов и задавать вопросы... Дальше геномные данные дают нам возможность предположить, что вирус может делать со своим бактериальным хозяином», — пояснил Салливан.

Как отметил соавтор работы Джошуа Вайц из Технологического института Джорджии, эта работа закладывает основу для создания прогностических моделей взаимодействия вирусов и микробов в природе.