Учёные представили новую технологию визуализации клеточного ядра
В ядре каждой клетки упаковано около 1,8 метров ДНК в пространство, в 50 раз меньшее ширины человеческого волоса. Эта ДНК, вместе с белковыми структурами (ядерными тельцами) и молекулами РНК, организована в трёхмерную структуру, которая влияет на функцию клетки.
Исследователи из Калтеха разработали новую технологию seqFISH+ для одновременной визуализации ДНК, РНК и белков в интактном клеточном ядре с высоким разрешением. Работа опубликована в журнале Nature 27 января 2021 года.
Ключевые преимущества метода:
- Позволяет увидеть полную картину организации ядра в отдельных клетках, а не усреднённую по популяции.
- Интегрирует возможности существующих технологий для масштабной визуализации.
Основные открытия, сделанные с помощью seqFISH+:
- Определённые участки генома детерминированно располагаются на поверхности ядерных телец, которые могут выступать в роли "строительных лесов" для генома.
- Эти пространственные взаимодействия ДНК с ядерными тельцами согласуются с данными о ДНК-белковых взаимодействиях, полученными ранее с помощью технологии ChIP-seq.
- Состояние ядра сильно гетерогенно между разными клетками — в большей степени, чем считалось ранее.
Перспективы применения:
- Исследование различий между ядрами раковых и здоровых клеток.
- Визуализация ядер в интактных тканях без необходимости разделения на отдельные клетки.