Консервативный сайт связывания антител в вариантах вируса COVID-19
Исследователи из Университета штата Пенсильвания обнаружили, что небольшой белок SARS-CoV-2 может иметь большое значение для будущих методов лечения.
Учёные впервые определили полную структуру N-белка (нуклеокапсидного) и выяснили, как антитела пациентов с COVID-19 взаимодействуют с ним. Структура оказалась схожей у многих коронавирусов, включая новые варианты SARS-CoV-2, что делает её идеальной мишенью для терапии и вакцин. Результаты опубликованы в Nanoscale.
Ключевые выводы:
- N-белок консервативен (сохраняется) среди вариантов SARS-CoV-2 и SARS-CoV-1.
- Сайт связывания антител на N-белке одинаков во всех исследованных образцах.
- Терапия, нацеленная на N-белок, может помочь в борьбе с тяжелыми или длительными симптомами COVID-19.
Почему это важно?
Большинство тестов и вакцин нацелены на S-белок (спайковый), который легко мутирует, что приводит к появлению новых вариантов. В отличие от него, N-белок:
- Защищён внутри вируса от внешних воздействий.
- Свободно циркулирует в крови после высвобождения из инфицированных клеток, вызывая сильный иммунный ответ.
- Именно его ищут тесты на антитела для определения перенесённой инфекции.
Методология:
Исследователи использовали комбинацию передовых методов:
- Крио-электронная микроскопия для визуализации N-белка и комплекса с антителами из сыворотки пациентов.
- Специальные микрочипы из нитрида кремния с покрытием, притягивающим белок.
- 3D-моделирование на основе полученных данных.
Это позволило получить изображения малых молекул SARS-CoV-2 с самым высоким на сегодня разрешением.
Перспективы:
Открытие консервативного сайта связывания на N-белке открывает путь для разработки:
- Широкодействующих терапевтических средств против различных вариантов вируса.
- Подходов для смягчения длительных симптомов у «ковид-дальнобойщиков (long haulers).