Новый метод определяет реакцию бактерий на антибиотики за пять минут

Исследователи из Каролинского института (Швеция) разработали молекулярный метод, способный определить, реагируют ли бактерии на антибиотики, в течение нескольких минут. Результаты представлены в журнале Nature Microbiology, и теперь учёные надеются создать простой тест для врачей.

Метод называется 5PSeq, прост в использовании и основан на секвенировании матричной РНК (mRNA), которую бактерии расщепляют в процессе синтеза белка. Измерения показывают, как бактерии реагируют на различные факторы окружающей среды, такие как лечение антибиотиками и другие виды стресса.

Быстрый тест для клинического применения

Исследователи протестировали метод на 96 видах бактерий из разных типов в сложных клинических образцах, взятых, например, из фекалий и влагалища, а также в образцах компоста. Уже через несколько минут они могли увидеть, реагируют ли бактерии на лечение антибиотиками; наиболее выраженный эффект был заметен примерно через полчаса.

Компания 3N Bio, основанная доктором Пелечано и его коллегами в инкубаторе KI Innovations, занимается разработкой метода и созданием быстрого молекулярного теста для клинического применения. Они уже получили финансирование от Шведского исследовательского совета для демонстрации доказательства концепции такого теста в сотрудничестве с Университетской больницей Каролинского института.

«Крайне важно, чтобы врачи могли быстро подобрать правильные антибиотики для тяжелобольных пациентов с бактериальными инфекциями, чтобы сократить неоправданное использование антибиотиков», — говорит доктор Пелечано. «Современные методы тестирования устойчивости к антибиотикам могут занимать часы или даже дни, но часто лечение необходимо назначить быстрее, чтобы избежать серьёзных последствий для пациента. Из-за этого часто назначают антибиотик широкого спектра действия, что увеличивает риск развития резистентности».

Помимо измерения устойчивости к антибиотикам, метод можно использовать, чтобы помочь исследователям понять, как бактерии справляются со стрессом и взаимодействуют друг с другом и со своими хозяевами. Учёные продолжат изучение сложных образцов из кишечника, чтобы исследовать, как бактериальные сообщества взаимодействуют в нашем кишечнике и способствуют здоровью или развитию болезней.