Новый атлас показывает, какие белки взаимодействуют в конкретных тканях

Исследователи из ETH Zurich создали атлас, показывающий, какие белки работают вместе в каких тканях. Эти данные помогут точнее идентифицировать гены болезней и разрабатывать лекарства, действующие строго в нужном месте. Работа опубликована в журнале Nature Biotechnology.

Анализ обширных данных

Учёные использовали биоинформатику и существующие коллекции данных о протеоме. Они проанализировали протеомные данные более чем 7800 человеческих биопсий и выявили тканеспецифичные белковые взаимодействия в одиннадцати различных типах тканей.

Каждое четвёртое взаимодействие уникально для ткани

Исследователи обнаружили, что каждое четвёртое белковое взаимодействие является тканеспецифичным. Например, взаимодействие может происходить только в ткани печени, но не в десяти других изученных типах тканей. Большинство различий между тканями связано с клеточными компонентами, специфичными для типов клеток.

Особенно высокое количество тканеспецифичных взаимодействий происходит в мозге и его нервных соединениях (синапсах). Для их изучения использовались данные лаборатории профессора ETH Бернда Воллшайда.

Перспективы для разработки лекарств

Знание органоспецифичных белковых взаимодействий помогает лучше понять механизмы болезней и точнее определить вовлечённые гены.

«Белки, работающие в команде, обычно также влияют на одно и то же заболевание. Если мы можем сказать, какие белки взаимодействуют исключительно в нервных клетках, мы можем лучше определить гены, вовлечённые в болезнь», — поясняет профессор Педро Бельтрао.

Это открытие может помочь в поиске активных веществ, воздействующих на белки в конкретном органе или ткани, что повысит безопасность лекарств за счёт их специфичности.