Расшифровка генома вируса, вызывающего COVID-19

Биологи из Лаборатории прикладной физики Университета Джонса Хопкинса Питер Тилен и Том Мехоке, ранее изучавшие геном гриппа, теперь применяют свой опыт для исследования нового коронавируса SARS-CoV-2.

Используя портативные ДНК-секвенаторы и методы молекулярной биологии, разработанные в том числе в их лаборатории, ученые проводят прямое секвенирование генома вируса из положительных тестов пациентов. Это позволяет отслеживать эволюцию и распространение патогена.

Ключевые выводы на основе первых данных:

• Скорость мутаций вируса SARS-CoV-2, по предварительным данным, значительно ниже, чем у вируса гриппа.
• Последствия для вакцины: Низкая скорость мутаций указывает на то, что, в отличие от ежегодной прививки от гриппа, вакцина от COVID-19, вероятно, будет единоразовой и не потребует частого обновления.
• Отслеживание распространения: Анализ мутаций (своего рода «ДНК-отпечаток») помогает устанавливать источники вспышек и пути передачи. Например, секвенирование уже связало вспышку в районе залива Сан-Франциско с круизным лайнером «Grand Princess».

Текущая работа:

Ученые уже проанализировали первые четыре образца из региона Балтимора и Вашингтона и ожидают обработки более 100. Они также оптимизировали процедуру, сократив время получения результатов до одного дня, и обучили методике сотрудников больниц и исследователей из разных стран в рамках виртуальных семинаров с Национальными институтами здравоохранения (NIH). Эта подготовка, как отмечает Тилен, была проведена именно для реагирования на будущую пандемию, которая теперь наступила.