Модель предсказывает эволюцию новых вариантов COVID-19
Международная исследовательская группа из Кёльнского университета и Медицинской школы Икан на горе Синай (Нью-Йорк) разработала модель, предсказывающую вероятную эволюцию вариантов вируса SARS-CoV-2.
Модель решает две задачи:
- Предсказывает, какие варианты смогут ускользать от иммунитета человека, распространяться в популяции и в итоге становиться новыми доминирующими вариантами.
- Определяет вероятные пути эволюции ускользания ещё до фактического появления новых вариантов.
Исследование "Population immunity predicts evolutionary trajectories of SARS-CoV-2" опубликовано в журнале Cell.
Эволюция вируса усложнилась: одновременно в мире циркулирует несколько конкурирующих вариантов. Прогностические модели необходимы для выявления тех из них, которые, вероятно, станут преобладающими в ближайшем будущем.
На "пригодность" (fitness) варианта влияют два фактора:
- Внутренние изменения, повышающие заразность.
- Иммунитет населения, сформированный предыдущими инфекциями или вакцинацией.
Новая модель использует эти факторы для расчёта разницы в пригодности между вариантами. Анализ основан на обширных международных экспериментальных данных, данных секвенирования, а также статистике инфекций и вакцинаций.
Ключевой вывод: человеческий иммунитет стал основной движущей силой эволюции SARS-CoV-2.
"Это означает, что даже после окончания пандемии вирус будет продолжать производить новые варианты, и нам нужны своевременные данные о них. Наши результаты показывают, насколько важны продолжающийся, международно скоординированный мониторинг вируса SARS-CoV-2", — заявил профессор д-р Михаэль Лессиг из Кёльнского института биологической физики, руководитель исследования.
Прогнозы эволюции вируса, полученные из этих данных, могут помочь в разработке вакцин, оптимально эффективных против будущих вариантов.
Исследование проведено в Центре прогнозного анализа вирусной эволюции (Previr) — международном междисциплинарном исследовательском центре при Кёльнском университете. Лаборатория Лессига много лет работает над прогнозным анализом вируса гриппа и консультирует ВОЗ по выбору вакцин против гриппа.