ДНК из "червячка" в мескале подтверждает утечку ДНК в консервирующие жидкости

Учёные из Института биоразнообразия Онтарио (BIO) Университета Гвельфа обнаружили, что даже если не проглатывать "червячка" со дна бутылки мескала, это не означает избежания контакта с его ДНК. Сама жидкость содержит ДНК гусеницы бабочки-агавы — того самого знаменитого "червя".

Исследование было частью проверки гипотезы о том, что ДНК консервированного образца может попадать в окружающую его жидкость. Команда BIO протестировала образец жидкости из бутылки мескала марки Monte Alban. В напитке была обнаружена ДНК, которую учёные амплифицировали и секвенировали, получив ДНК-штрихкод.

Сравнение с тысячами записей ДНК-штрихкодов чешуекрылых в базе данных Barcode of Life Data Systems (BOLD) подтвердило, что в мескале содержится ДНК, относящаяся к семейству Cossidae, к которому принадлежит и бабочка-агава.

Кроме мескала, учёные также успешно амплифицировали и секвенировали ДНК-штрихкоды из 95% этанола, использовавшегося для консервации:

• 70 свежесобранных образцов (целые насекомые — ручейники и подёнки, а также листья растений).
• 7 архивных образцов разных типов, собранных 7–10 лет назад.

Отчёт об исследовании опубликован в онлайн-версии журнала BioTechniques. Работа является частью фазы разработки технологий международного проекта International Barcode of Life (iBOL).

"Эти результаты позволяют предположить, что экстракция ДНК является излишним шагом во многих [молекулярно-биологических] протоколах", — говорится в отчёте. — "Консервирующий этанол может быть использован в качестве источника генетического материала для неинвазивного отбора проб или когда не остаётся тканевого образца для дальнейшего анализа ДНК".

Успешная идентификация ДНК гусеницы агавы стала "неожиданным результатом", учитывая, что мескал — неидеальная среда для сохранения ДНК (всего 40% этанола и множество примесей, способных её разрушить). Хотя из мескала не удалось получить полноразмерный ДНК-штрихкод, при работе с 95% этанолом от свежесобранных образцов успешность была почти стопроцентной.

"То, что ДНК консервированного образца можно извлечь из консервирующей жидкости, открывает ряд важных возможностей, — сказал доктор Мехрдад Хаджибаеби, член исследовательской группы. — Мы можем разработать недорогие, высокопроизводительные и неинвазивные протоколы генетического анализа для ситуаций, когда исходную ткань нельзя трогать или когда образца для анализа просто не осталось".