Исследование раскрывает доиспанскую историю и генетические изменения среди коренных народов Мексики

Международная команда под руководством мексиканских учёных провела крупнейшее на сегодняшний день геномное исследование коренных народов Америки. Они секвенировали экзомы (кодирующие белок регионы генома) 78 человек из пяти групп: северные (Rarámuri/Tarahumara и Huichol), центральные (Nahua), южные (Triqui, TRQ) и юго-восточные (Maya, MYA).

Демографическая история

На основе анализа 120 735 однонуклеотидных вариантов (SNV) учёные смоделировали демографическую историю:

• Разделение северных и южных этнических групп (Tarahumara и Huichol) произошло 7.2 тыс. лет назад.
• Последующее локальное расхождение групп Huichol — 6.5 тыс. лет назад.
• Расхождение групп Triqui и Maya — 5.7 тыс. лет назад.

Эти данные согласуются с предыдущими оценками, согласно которым предки коренных американцев разделились ~17.5–14.6 тыс. лет назад на "Предков А" (юг) и "Предков Б" (север), а заселение Мексики началось не менее 12 000 лет назад.

Гены адаптации

При сканировании данных были идентифицированы гены-кандидаты, важные для адаптации, в том числе ранее обнаруженные у других популяций:

• SLC24A5 — пигментация кожи.
• FAP — возможная адаптивная интрогрессия от архаичных людей.
• Гены иммунного ответа: SYT5, IL17A, IL13.
• BCL2L13 — высоко экспрессируется в скелетных мышцах; может быть связан с физической выносливостью, характерной для северных народов (например, Rarámuri, известных как бегуны на длинные дистанции).
• KBTBD8 — ассоциирован с идиопатическим низким ростом; высокодифференцирован у народа Triqui, чей рост крайне низок по сравнению с другими коренными группами.

Новые генетические варианты

Исследование выявило более четырёх тысяч новых генетических вариантов, большинство из которых — синглтоны. Среднее число синглтонов на человека было выше у народов Nahua (NAH) и Maya (MYA), что ожидаемо, учитывая их происхождение от крупнейших мезоамериканских цивилизаций.