Геномное исследование выявило признаки адаптации к туберкулёзу у древних жителей Анд

Новое геномное исследование показало, что коренные народы на территории современного Эквадора адаптировались к бактерии туберкулёза (ТБ) тысячи лет до прихода европейцев. Результаты опубликованы в журнале iScience.

Ключевые выводы:

• Адаптация к ТБ: Самые сильные генетические сигналы положительного отбора были связаны не с высотной адаптацией, а с иммунным ответом на туберкулёз.
• Время отбора: Отбор генов, вовлечённых в пути ответа на ТБ, начал усиливаться чуть более 3000 лет назад. Этот период совпадает с распространением земледелия в регионе, что вело к росту плотности населения и облегчало распространение респираторных патогенов.
• Подтверждение древнего ТБ: Результаты предоставляют первые свидетельства ответа иммунной системы человека на ТБ у древних андцев и согласуются с более ранними находками бактерии ТБ в костном материале андских мумий возрастом 1400 лет.

Методология:

Учёные секвенировали полные геномы по образцам крови 15 современных коренных жителей Эквадора, проживающих на высоте более 2500 метров. С помощью вычислительных методов они искали в их геномах признаки положительного отбора в прошлом.

Другие наблюдения:

• Были также обнаружены, хотя и менее выраженные, сигналы отбора, связанные с адаптацией к гипоксии (недостатку кислорода на высоте).
• Некоторые гены, вовлечённые в адаптацию к высоте, пересекались с данными по перуанским Андам, но варианты (аллели) были разными. Это может указывать на независимые адаптации даже среди небольших популяций.

Значение исследования:

Изучение коэволюции человека и патогенов в прошлом может дать важные сведения для современного здравоохранения и поиска новых методов лечения инфекционных заболеваний.