Обнаружен самый богатый интронами эукариотический геном

Исследователи из Университета Цукубы расшифровали ядерный геном Amorphochlora amoebiformis — одноклеточной морской водоросли из группы хлорарахниофитов.

Работа опубликована в журнале DNA Research.

Использование технологии секвенирования длинными прочтениями позволило собрать ядерный геном A. amoebiformis. Его длина составляет около 214 миллионов пар оснований, и он кодирует примерно 17 500 белков.

Ключевое открытие: интроны (некодирующие последовательности, обычно удаляемые при сплайсинге) составляют примерно 74% последовательности генома. Это делает геном A. amoebiformis самым богатым интронами среди всех известных эукариот.

Для сравнения, у близкородственного вида хлорарахниофитов Bigelowiella natans доля интронов составляет около 30%. Это указывает, что масштабное увеличение числа интронов в геноме A. amoebiformis произошло независимо в ходе его эволюции.

Причина такого резкого роста доли интронов пока неизвестна. Это исследование даёт важные сведения об эволюционной динамике и потенциальных функциональных ролях интронов в эукариотических геномах.