Атомная структура фермента гибели клеток растений открывает путь к безопасной защите урожая

Учёные из Университета Рутгерса и Брукхейвенской национальной лаборатории после 30 лет исследований получили детальное представление о внутренней структуре и механизме регуляции специализированного фермента — метакаспазы 9. Это открывает путь к созданию инструментов для защиты растений от болезней.

Исследование, опубликованное в Nature Communications, основано на изучении запрограммированной гибели клеток — естественного процесса, при котором клетки целенаправленно отмирают ради здоровья всего растения.

Ключевые методы и открытия

  • Используя растение Arabidopsis thaliana, учёные применили рентгеновскую кристаллографию на синхротроне NSLS-II, чтобы определить форму метакаспазы 9 на атомном уровне.
  • Комбинируя данные кристаллографии с молекулярным динамическим моделированием и лабораторными экспериментами (включая сайт-направленный мутагенез), команда выяснила, как фермент активируется при повышении кислотности (снижении pH).
  • Было обнаружено, что разные части фермента действуют как «тормоза» или «ускорители», обеспечивая его активность только в кислой среде.

Роль в защите растений

Метакаспаза 9 играет центральную роль в борьбе с двумя типами патогенов:

  1. Биотрофы (например, фитофтора Phytophthora infestans, вызвавшая картофельный голод в Ирландии) питаются живыми клетками. Активация метакаспазы 9 помогает убить заражённые клетки, лишив патоген пищи.
  2. Некротрофы (например, гриб Sclerotinia sclerotiorum, вызывающий белую гниль) сначала убивают клетки. Здесь фермент может быть «угнан» патогеном для ускорения гибели здоровых клеток.

Практические перспективы

  • Учёные уже создали «сверхактивные варианты» (super-active variants) метакаспазы 9. Их внедрение в растения может обеспечить устойчивость к биотрофным болезням (мучнистая роса, ржавчина) за счёт ранней гибели клеток в месте вторжения.
  • Понимание структуры фермента позволяет разрабатывать новые агрохимикаты, которые будут избирательно блокировать метакаспазу 9 для защиты от некротрофов, не нанося вреда животным и окружающей среде.
  • Исследователи подали заявку на временный патент в Ведомство по патентам и товарным знакам США на технологии, вытекающие из этого открытия.

Значение: Работа предлагает новые, потенциально более безопасные и эффективные стратегии защиты сельскохозяйственных культур от болезней, которые, по данным Минсельхоза США, ежегодно приводят к потерям 10–20% урожая и ущербу в $100–200 млрд.