Обнаружены невидимые грибы по их генетическому материалу

Исследователи из Уппсальского университета, используя новый метод поиска ДНК в образцах почвы, выявили существование двух ранее неизвестных, но очень распространённых видов грибов. Они, вероятно, выполняют ключевую функцию в экосистеме. Исследование опубликовано в журнале IMA Fungus.

Большинство грибов не образуют заметных плодовых тел. Новые виды, невидимые невооружённым глазом, широко распространены в лесных почвах Северной и Центральной Европы, что показал анализ ДНК.

Грибы были обнаружены в почвенных образцах с полевой станции Ивантъярнхеден в Естраос (провинция Естрикланд, Швеция). Метод учёных основан на извлечении как длинных последовательностей ДНК (для изучения родства видов), так и коротких (для оценки распространённости).

Анна Рослинг, руководившая работой:

"Наши данные показывают, что это два близкородственных, но различных вида, конкурирующих за ресурсы в почвенном профиле. Один выигрывает и доминирует в органической почве — мы назвали его Archaeorhizomyces victor. На втором месте — Archaeorhizomyces secundus, который в большей степени довольствуется ресурсами минеральной почвы".

Там, где виды сосуществуют (в почве и корнях смешанного и хвойного леса), Archaeorhizomyces victor преобладает в богатом гумусом слое. Чуть глубже, в менее питательной почве, victor чувствует себя плохо, и secundus может стать широко распространённым.

Эти виды относятся к классу Archaeorhizomycetes — древних грибковых эндофитов корней. Они колонизируют корневую ткань растений, живут в симбиозе с хозяином, улучшая его жизнедеятельность, не причиняя явного вреда. Из почвенных образцов по всему миру известно, что этот класс включает не менее 1000 видов. Эти грибы обычны: в образцах из Ивантъярнхедена они составляют примерно 30% всего секвенированного генетического материала.

Этот большой класс грибов был впервые научно описан в 2011 году той же исследовательской группой Анны Рослинг, которой также удалось культивировать два вида в лаборатории. Грибы растут медленно, имеют слегка бежевый цвет и образуют споры разной формы.

С двумя новыми видами число известных видов Archaeorhizomycetes удвоилось. Ещё важнее, по мнению исследователей, то, что они установили метод идентификации новых видов, не зависящий от культивирования или нахождения плодового тела. Наличие определённых маркерных генов в почвенных образцах указывает, что почти 90% всех грибов ещё не описаны наукой.

Анна Рослинг:

"Нашим исследованием мы хотим дать представление о tremendous diversity грибов в почве и важности их называть, даже если мы ещё не видели их невооружённым глазом".