Геном за $1000 может стать реальностью к 2013 году
Новая машина для секвенирования ДНК, созданная Джонатаном Ротбергом из Ion Torrent Systems, использует полупроводниковые технологии и приближает достижение цели — полное секвенирование человеческого генома за $1000.
Как работает технология:
- Устройство представляет собой кремниевый чип с 1,2 миллиона сенсоров в виде микроскопических лунок.
- В лунках находятся шарики с фрагментами секвенируемой ДНК.
- Сенсоры напрямую измеряют ионы водорода (H+), выделяющиеся в процессе репликации ДНК.
Первый пациент и прогноз:
Первым, чей геном был прочитан на этой машине, стал сооснователь Intel Гордон Мур. Ротберг считает, что Мур, подаривший миру современные полупроводники, должен быть первым, кого протестируют с их помощью. Именно закон Мура (количество транзисторов на чипе удваивается каждые два года) позволяет Ротбергу верить, что его технология достигнет отметки в $1000 за геном к 2013 году.
Текущее состояние и применение:
- Существующая машина стоит около $49 000 и уже используется в более чем 40 странах.
- Компания Ion Torrent недавно выпустила новую модель, в 10 раз более производительную, и планирует представить ещё более совершенную в течение полугода.
- Чипы для секвенирования стоят 99 * *каждый.ДлячтениягеномаМурапотребовалось * *1000 * *чипов(ранееонистоили * *250).
- Помимо быстрого (за несколько часов) секвенирования генома человека, машина недавно использовалась в Китае и Германии для анализа генома бактерии E. coli во время вспышек. Вместо обычных 2–8 недель учёные определили штамм E. coli всего за 3 дня, что позволило оперативно принять меры.
Ротберг уверен, что технологический прогресс к 2013 году позволит сделать чипы ещё дешевле и секвенировать полный человеческий геном всего за $1000.