Геномная последовательность COVID у кошки почти идентична вирусным последовательностям у людей
С момента обнаружения у людей в 2019 году SARS-CoV-2 заразил широкий спектр видов животных, диких и домашних. Существуют опасения, что такие межвидовые переходы могут привести к новым мутациям и даже к появлению вредных вариантов вируса.
В новом отчёте исследователи из Школы ветеринарной медицины и Медицинской школы Перельмана Пенсильванского университета обнаружили, что по крайней мере в одном случае очевидной межвидовой передачи переход через видовой барьер не привёл к значительному накоплению мутаций вирусом.
В статье в журнале Viruses учёные описали домашнюю кошку, проходившую лечение в ветеринарной больнице Райана, которая была инфицирована дельта-вариантом SARS-CoV-2 после контакта с владельцем. Полная геномная последовательность вируса была близким совпадением с вирусными последовательностями, циркулировавшими среди людей в регионе Филадельфии в то время.
"SARS-CoV-2 имеет действительно невероятно широкий круг хозяев", — говорит Элизабет Леннон, старший автор работы, ветеринар и доцент в Penn Vet. — "Для меня это означает, что, пока SARS-CoV-2 продолжает преобладать в популяции людей, нам нужно следить за тем, что происходит и с другими видами животных".
Этот случай стал первым опубликованным примером обнаружения дельта-варианта у домашней кошки в США. Примечательно, что инфекция у кошки была выявлена только при тестировании её фекалий. Мазок из носа не дал положительного результата.
"Это подчеркнуло важность взятия проб с нескольких участков тела", — говорит Леннон. — "Мы бы не обнаружили это, если бы сделали только мазок из носа".
Леннон и её коллеги занимаются отбором проб у собак и кошек на SARS-CoV-2 с начала пандемии. Эта конкретная домашняя кошка, 11-летняя самка, была доставлена в больницу Райана в сентябре с желудочно-кишечными симптомами. Она контактировала с владельцем, у которого был COVID-19, хотя этот владелец изолировался от кошки за 11 дней до её госпитализации, а уход за кошкой в это время осуществлял другой член семьи.
Работая через Пеннский центр исследований коронавирусов и других возникающих патогенов и лабораторию микробиолога Медицинской школы Перельмана Фредерика Бушмана, команда получила полную геномную последовательность вируса кошки.
Секвенирование выявило дельта-вариант, а именно линию AY.3. У исследователей не было образца от инфицированного владельца. Однако при сравнении последовательности с базой данных лаборатории Бушмана вирус кошки не отличался от последовательностей SARS-CoV-2, циркулировавших в регионе Долины Делавэр в то время.
"Когда мы посмотрели на случайную выборку человеческих последовательностей из нашего географического района, в образце нашей кошки не было ничего кардинально иного", — говорит Леннон. — "Таким образом, наш вывод заключался в том, что кошка была инфицирована вирусом, который каким-то образом сильно не отличался".
Не все варианты SARS-CoV-2 были в равной степени способны заражать широкий круг хозяев. Например, исходный уханьский штамм не мог естественным образом заражать мышей; более поздние варианты приобрели эту способность. Учёные начали фиксировать инфекции у кошек и собак с первых дней пандемии, предположительно заразившихся при тесном контакте со своими владельцами.
"Главный вывод здесь заключается в том, что по мере появления различных вариантов SARS-CoV-2 они, по-видимому, сохраняют способность заражать широкий спектр видов", — говорит Леннон.
Хотя этот конкретный случай не вызывает тревоги по поводу приобретения вирусом значительного количества мутаций при переходе между видами, Леннон и её коллеги, включая Бушмана и Сьюзан Вайс из медицинской школы Пенна, надеются продолжить изучение других примеров, чтобы понять, как эволюционирует SARS-CoV-2. Институт инфекционных и зоонозных заболеваний Penn Vet будет способствовать изучению взаимодействия человека и животных, когда речь идёт о передаче патогенов.
"Мы знаем, что SARS-CoV-2 претерпевает изменения, передаваясь, чтобы со временем становиться всё более и более трансмиссивным", — говорит Леннон. — "Мы видели это с вариантом омикрон. Он адаптируется к человеку как хозяину. Мы также хотим знать: когда заражаются другие виды животных, начинает ли вирус адаптироваться к этим видам? И для тех вирусов, которые могут адаптироваться к другому виду, могут ли они по-прежнему заражать людей?"