Новая база данных для экологических исследований морских организмов
Функционирование экосистем, то есть роль организмов в экосистеме, становится все более важным в морской экологии и охране природы. Чтобы облегчить такие исследования, международная команда ученых под руководством С. Фаулветтера из Эллинского центра морских исследований (HMRC) представляет базу данных Polytraits, цель которой — предоставлять повторно используемые и доступные данные о морских многощетинковых червях. Статья, описывающая новую базу данных, опубликована в инновационном Biodiversity Data Journal, пионере в публикации интегрированных биологических данных.
Донные организмы участвуют во многих биологических процессах в мировых водных бассейнах. Их функциональное разнообразие — важное свойство сообщества, демонстрирующее роль организмов в экосистеме и помогающее понять, как сообщество реагирует на изменения окружающей среды. Многощетинковые черви, или полихеты, — морские черви, известные своими причудливыми формами и часто яркой окраской. Во всем мире описано более 10 000 видов этого класса, большинство из которых обитают в шельфовой зоне морей и океанов, зарываясь в осадок или плавая в планктоне.
В настоящее время база данных Polytraits содержит почти 20 000 записей о морфологических, поведенческих и репродуктивных характеристиках более 1000 видов, все с ссылками на литературные источники. Все данные об этих увлекательных организмах можно свободно получить через веб-сайт проекта различными способами и в разных форматах, как удобочитаемых для человека, так и машиночитаемых. Новая база данных представляет собой богатую и простую в использовании коллекцию, которая охватывает морфологические, репродуктивные и поведенческие характеристики полихет, а также информацию об экологических предпочтениях, в попытке облегчить экологические исследования и исследования по сохранению видов.
Исследователи также предоставляют передовой подход к доступу, интеграции и повторному использованию данных. Через программные интерфейсы информация о жизненном цикле автоматически интегрируется в Polychaetes Scratchpads вместе с другими данными о полихетах. Scratchpads — это простые в использовании, адаптируемые инструменты с мощными возможностями для управления данными о биоразнообразии. Эта таксон-ориентированная виртуальная исследовательская среда позволяет просматривать таксономическую классификацию и извлекать различную релевантную информацию для каждого таксона, включая собранные биологические признаки.
Кроме того, данные также доступны через TraitBank Энциклопедии жизни (Encyclopedia of Life), которая в настоящее время содержит более 3 миллионов записей, связанных с более чем 250 атрибутами для 272 720 таксонов, включая данные Polytraits. TraitBank служит поставщиком агрегированных данных о признаках видов. Все загруженные туда данные архивируются и интегрируются с информацией о признаках из других источников для решения проблем стандартизации научных данных. Это первая комплексная база данных для морских организмов, опубликованная таким инновационным способом, и еще один пример сотрудничества между издателем данных Pensoft и Энциклопедией жизни.