Мутации в iPS-клетках в основном сосредоточены в нетранскрибируемых областях генома

Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (iPS-клетки) — перспективное направление регенеративной медицины. Однако существуют опасения, что мутации, возникающие в этих клетках в процессе их получения, могут представлять риск, в частности, вызывать злокачественные образования у пациентов после трансплантации.

Исследование, опубликованное в Cell Reports группой из RIKEN Preventive Medicine and Diagnosis Innovation Program, показало, что в отличие от болезнетворных однонуклеотидных полиморфизмов, мутации в iPS-клетках мыши и человека имеют тенденцию концентрироваться в нетранскрибируемых областях генома между генами.

Ключевые выводы:

• Новые мутации в iPS-клетках, вероятно, вызваны окислительным стрессом.
• Мутации сконцентрированы в специфических областях — lamina-associated domains (LAD). Эти домены расположены на периферии ядра клетки и характеризуются конденсированным хроматином, чувствительным к окислительному повреждению от митохондрий.
• Большинство несинонимичных мутаций (приводящих к изменению белка) не были обнаружены в каталогах раковых мутаций, то есть являются новыми и требуют дальнейшего изучения.

По словам руководителя исследования Ясухиро Муракавы, хотя в процессе репрограммирования возникает много мутаций, многие из них находятся в репрессированных транскрипционно LAD-доменах, что позволяет предположить их низкий потенциал к неблагоприятным эффектам. Это исследование дает основу для анализа вариаций в геномах iPS-клеток и поможет в разработке новых терапий.