Сравнение геномов мыши и человека подтверждает ценность мышиной модели для исследований

Учёные из Стэнфордского университета подтвердили, что лабораторная мышь остаётся одной из лучших моделей для изучения человеческих болезней. Исследование в рамках проекта Mouse ENCODE показало, что основные принципы регуляции генов у мышей и людей схожи.

Однако обнаружены и важные различия в деталях регуляции, которые определяют видовую специфику.

"В конечном счёте, многие гены у мыши и человека идентичны, но мы утверждаем, что то, как они регулируются, довольно сильно различается", — говорит профессор Майкл Снайдер.

Цель проекта Mouse ENCODE

Проект Mouse ENCODE дополняет более ранний проект ENCODE (Encyclopedia of DNA Elements), начатый в 2003 году для изучения регуляторных элементов в геноме человека. Оба проекта координируются Национальным институтом исследования генома человека (NHGRI).

Mouse ENCODE проанализировал более 100 типов клеток и тканей мыши, чтобы аннотировать регуляторные элементы её генома и сравнить их с человеческими. Это помогает понять, насколько результаты исследований на мышах могут быть перенесены на людей.

Ключевые результаты

  1. Общие принципы, разные детали. Исследователи сравнили, как 34 транскрипционных фактора связываются с ДНК в участках, называемых сайтами связывания. Общие принципы работы этих факторов одинаковы, но конкретные места их связывания в геноме (целевые гены) часто различаются.
  2. Специфика экспрессии генов. Профили экспрессии генов в 15 типах тканей показали, что ткани мыши больше похожи друг на друга, чем на соответствующие человеческие ткани. Например, мышиная печень по экспрессии генов больше похожа на мышиную почку, чем на человеческую печень.

Практическое значение

Обилие данных Mouse ENCODE — ценный ресурс для учёных, изучающих болезни. Теперь они могут проверять, одинаковы ли или различны регуляторные механизмы (транскрипционные факторы) для конкретных генов у мыши и человека.

"Если вы сосредоточены на гене, который похож у человека и мыши, результат легче перенести с мыши на человека", — отмечает постдок Йонг Ченг. — "Но если вы работаете с геном, который различается, нужно уделить больше внимания тому, можно ли успешно применить этот результат к людям".

Исследование подтверждает фундаментальную важность мыши как модельного организма, одновременно подчёркивая необходимость учёта видовых различий в регуляции генов при интерпретации экспериментов.