Длинная некодирующая РНК TARL помогает рыбам противостоять инфекции Vibrio, регулируя стабильность TAK1
В исследовании, опубликованном в журнале Science China Life Sciences, в качестве объекта изучения была взята рыба Miichthys miiuy (миуй), чтобы выяснить, может ли lncRNA играть регуляторную роль в процессе сопротивления рыбы инфекции патогенной бактерии Vibrio. Исследователи обнаружили, что экспрессия lncRNA TARL повышалась в ткани селезенки M. miiuy, стимулированной LPS.
Дальнейший анализ показал, что lncRNA TARL:
- Способствует экспрессии воспалительных цитокинов.
- Значительно усиливает способность хозяина противостоять вторжению Vibrio anguillarum.
Это указывает на то, что lncRNA TARL участвует во врожденном антибактериальном иммунном ответе M. miiuy, играя положительную регуляторную роль. Анализ локализации доказал, что lncRNA TARL находится в цитоплазме.
Последующие эксперименты (биоинформатический анализ, RIP, RNA pulldown) подтвердили, что lncRNA TARL может напрямую взаимодействовать с miR-2188-3p. Ранее было доказано, что miR-2188-3p подавляет врожденный иммунный ответ M. miiuy против бактерий и способствует ускользанию V. anguillarum и V. harveyi.
Дальнейшие результаты показали, что seed-последовательность miR-2188-3p подавляет стабильность мРНК TAK1, связываясь с областью 3'UTR этой мРНК. Исследования также выявили, что TAK1 критически важен для сопротивления M. miiuy инфекции Vibrio. При снижении экспрессии TAK1 эффективность ускользания V. anguillarum значительно повышалась, что подтвердило роль TAK1 как ключевого узла в антибактериальном иммунном ответе.
Механизм: LncRNA TARL усиливает врожденный иммунный ответ хозяина, конкурируя с мРНК TAK1 за связывание с miR-2188-3p. Это помогает хозяину противостоять инфекции V. anguillarum и V. harveyi.
Исследование дает новое понимание влияния lncRNA на иммунитет хозяина и ускользание бактерий, что важно для разработки мер профилактики рыбных болезней, направленных на борьбу с опасными грамотрицательными бактериями. Работа выполнена под руководством доктора Tianjun Xu (Лаборатория молекулярной иммунологии рыб, Шанхайский океанический университет).