Роль новой длинной некодирующей РНК в иммунном ускользании патогенных вибрионов у рыб
МикроРНК (miRNA) — это небольшие некодирующие РНК, регулирующие почти все биологические процессы, включая производство белка, воспалительные реакции, иммунную регуляцию, опухолеобразование и инфекцию. У млекопитающих классическое образование miRNA требует транскрипции длинной первичной miRNA в ядре с последующей обработкой в шпилечную РНК длиной около 60–70 нуклеотидов. В конечном итоге эта предшественница miRNA транспортируется в цитоплазму для обработки и разрезания, что приводит к образованию зрелой miRNA.
В последние десятилетия появились сообщения об альтернативном пути образования miRNA. Гены, кодирующие некоторые miRNA, фактически расположены в генах длинных некодирующих РНК (lncRNA) и транскрибируются вместе с lncRNA. Также растёт количество доказательств критической и незаменимой роли lncRNA во врождённом иммунитете млекопитающих. Однако подобные доказательства у низших позвоночных, таких как костистые рыбы, отсутствуют.
Исследовательская группа из Шанхайского океанического университета под руководством Тяньцзюня Сюй взялась выяснить функции и характеристики lncRNA у костистых рыб.
«Мы идентифицировали регуляторную сеть оси lncRNA-miRNA-mRNA, участвующую в антибактериальных ответах у костистой рыбы — желтого горбыля, важного вида морской рыбы, поддерживающего промысловый лов и аквакультуру», — говорит Сюй.
«Было показано, что новая иммуно-ассоциированная lncRNA MIR144HG негативно регулирует антибактериальный иммунитет желтого горбыля, вызванный бактериями Vibrio anguillarum и Vibrio harveyi — двумя наиболее восприимчивыми грамотрицательными патогенами в аквакультуре. Экономические потери, причиняемые этими двумя бактериями ежегодно, неисчислимы».
Предыдущие сообщения о lncRNA у костистых рыб показывали, что она в основном положительно регулирует врождённый иммунный ответ. Впервые некодирующая РНК обнаружена в роли фактора, способствующего ускользанию двух бактерий у костистой рыбы. Более того, команда продемонстрировала, что MIR144HG может функционировать как предшественник miR-144–3p, продуцируя miR-144–3p и усиливая ингибирующий эффект miR-144–3p на белки MyD88, TAK1 и p65, тем самым подавляя антибактериальный иммунный ответ.
Также были получены доказательства участия MyD88 и p65 в регуляции врождённого иммунного ответа, вызванного двумя вибрионами, причём оба белка играют важную роль в борьбе с инвазией V. anguillarum.
Результаты исследования команды опубликованы в журнале Water Biology and Security.
«Это исследование не только проясняет механизмы оси lncRNA-miRNA-mRNA в антибактериальных иммунных ответах, но и проливает свет на влияние lncRNA на иммунитет хозяина и бактериальное ускользание», — говорит Сюй.