Обнаружен новый механизм экспрессии генов вируса РРСС

Совместное исследование с участием учёных из Университета штата Канзас обнаружило новый механизм экспрессии генов у вируса репродуктивного и респираторного синдрома свиней (РРСС) — важного патогена, наносящего свиноводческой отрасли США ущерб более $600 млн в год. Это открытие предоставляет учёным новое направление для разработки стратегий контроля и профилактики болезни.

Исследование под руководством Ин Фан, доктора философии, доцента кафедры диагностической медицины и патобиологии, показало, что новый белок вируса, nsp2TF, образуется благодаря уникальным сигналам сдвига рамки рибосомного считывания.

Работа «Трансактивация запрограммированного рибосомного сдвига рамки вирусным белком» была недавно опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

  • Исследование основано на более ранней работе 2012 года, также опубликованной в PNAS, в которой был впервые идентифицирован белок nsp2TF, экспрессируемый через механизм -2 рибосомного сдвига рамки.
  • «Сдвиг рамки происходит, когда рибосома сталкивается со "скользкой" последовательностью и нижележащим сигналом в матричной РНК (mRNA), — пояснила Ин Фан. — Это заставляет рибосому сместиться на два нуклеотида назад, в результате чего все генетические кодоны ниже места сдвига считываются иначе и производят новый белок с другой функцией».

В новом исследовании Фан и её коллеги показали, что для этого -2 сдвига рамки требуется вирусный белок PRRS — nsp1beta. Это первый случай, когда для индукции рибосомного сдвига рамки генетическому механизму вируса потребовалось действие транс-активирующего вирусного белка, а не структуры РНК, что является новым для области трансляции белков.

  • Функция белка nsp2TF в настоящее время изучается. Он содержит генетический элемент, который может быть ответственен за подавление иммунной системы свиньи.
  • Новый механизм сдвига рамки может стать дополнительной мишенью для противовирусной терапии. Лаборатория Фан клонировала вирус РРСС и создала генетически модифицированные вирусы с «нокаутом» белка nsp2TF.
  • «Эти вирусы-нокауты потенциально могут быть использованы для разработки вакцин, — отметила Фан. — Кроме того, этот новый механизм экспрессии генов может также использоваться другими вирусами или в клеточной экспрессии генов».