Исследование обнаружило огромное разнообразие вирусов, поражающих бактерии
Вирусы, поражающие бактерии (бактериофаги), — одни из самых многочисленных форм жизни на Земле. Они играют ключевую роль в сдерживании роста бактерий в океанах, почвах и, возможно, даже в наших телах.
Новое исследование Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе показывает, что бактериофаги с РНК-геномом (химическим "кузеном" ДНК), вероятно, играют гораздо большую роль в формировании бактериального состава различных сред обитания, чем считалось ранее.
Исследование, опубликованное 24 марта в журнале PLOS Biology, выявило 122 новых типа РНК-бактериофагов в разнообразных экологических нишах. Это открывает возможности для изучения их вклада в экологию и потенциального использования для борьбы с бактериальными инфекциями, особенно устойчивыми к антибиотикам.
"Было идентифицировано множество ДНК-бактериофагов, но понимание РНК-бактериофагов невероятно скудно. Их в значительной степени игнорировали — было известно о существовании относительно немногих, и в основном ученые не удосуживались их искать. Это исследование ставит РНК-бактериофаги на карту и открывает множество новых направлений для исследований", — объяснил старший автор Дэвид Ван.
По оценкам Вана, из более чем 1500 идентифицированных бактериофагов 99% имеют ДНК-геномы. Масштабное секвенирование геномов помогло обнаружить ДНК-фаги в кишечнике, коже и крови человека, а также в окружающей среде, но РНК-фаги в этих образцах искали редко.
Команда под руководством первого автора Сиддхартха Кришнамурти проанализировала данные из:
Ключевые выводы:
- Известно, что РНК-бактериофаги заражают грамотрицательные бактерии, которые становятся все более устойчивыми к антибиотикам и являются источником многих внутрибольничных инфекций.
- Впервые показано, что эти фаги, возможно, могут также заражать грамположительные бактерии, ответственные за стрептококковые и стафилококковые инфекции, включая MRSA.
"То, что мы знаем о РНК-бактериофагах в любой среде, ограничено. Но вы можете думать о бактериофагах и бактериях как о хищнике и жертве. Нам нужно понять динамику этих отношений. В конечном итоге мы хотели бы манипулировать этой динамикой, чтобы использовать фаги для избирательного уничтожения конкретных бактерий", — отметил Ван.