Необходимо развивать мировую инфраструктуру биобанков для микробиомов

Международная команда учёных под руководством доктора Мэттью Райана из CABI представила обзор проблем и возможностей, связанных с сохранением («банкингом») микробиомов — сложных сообществ бактерий, архей, грибов, водорослей, протистов и вирусов — для будущих поколений.

Исследователи, чья работа опубликована в журнале Trends in Microbiology, призывают создать приоритетный список объектов для сохранения с научной, экономической, социальной и экологической точек зрения. Они отмечают, что текущая инфраструктура биобанков «фрагментирована и не готова для банкирования микробиомов».

Ключевые проблемы и сдвиг парадигмы

  • Современные биобанки традиционно сохраняют образцы отдельных организмов или стерильные культуры.
  • Микробиомная наука требует перехода от сохранения свободных от микробов образцов (например, семян) к сохранению сложных сообществ, что диктует необходимость развития новой инфраструктуры.
  • Основная технологическая проблема — разработка оптимизированных методов сохранения микробиомов и оценки успеха этого сохранения с точки зрения поддержания их состава и функциональности.

Риски и важность сохранения

  • Неоптимальные методы хранения могут непреднамеренно и фундаментально изменить функциональность и целостность динамической системы микробиома.
  • Удаление даже одного ключевого микробного компонента может необратимо повлиять на всю систему.
  • Биобанки необходимы для обеспечения качества исследований, независимой верификации результатов, разработки продуктов (например, пробиотиков) и сохранения биоразнообразия в условиях изменяющихся практик и климата.

Текущее состояние и методы

  • Среди существующих инициатив отмечается «Хранилище Микробиоты» (Microbiota Vault) — первый крупный шаг к созданию комплексного ресурса.
  • Криоконсервация остаётся «золотым стандартом» для хранения микроорганизмов с 1960-х годов.

Выводы и призыв к действию

Учёные подчёркивают комплементарность традиционных коллекций культур и новых биобанков. Для эффективной поддержки исследований в области микробиома необходимы совместные усилия по выявлению инфраструктурных пробелов и налаживанию сотрудничества в ЕС и за его пределами.