Новый алгоритм для быстрого выявления устойчивости к антибиотикам

Исследователи под руководством микробиолога профессора доктора Акселя Хампрехта из Университетской медицины Ольденбурга разработали новый метод, позволяющий быстрее выявлять часто упускаемую из виду устойчивость к антибиотикам. Команда сосредоточилась на определении того, устойчив ли штамм бактерии Proteus mirabilis к определенным антибиотикам, что делает их неэффективными. Инфекция этой бактерией может привести к инфекциям мочевыводящих путей, раневым инфекциям, инфекциям кровотока и пневмонии. Инновационную технику представили в журнале Clinical Microbiology and Infection.

Исследователи продемонстрировали, что устойчивость к резервным антибиотикам (антибиотикам последней линии) у Proteus mirabilis встречается гораздо чаще, чем считалось ранее, и часто остается невыявленной при использовании текущих стандартных методов тестирования. Для идентификации этих резистентностей группа использовала передовые методы молекулярной биологии, включая секвенирование нового поколения (next-generation sequencing), позволяющее параллельно секвенировать многие сотни генов.

На основе этих данных исследователи смогли разработать метод быстрого и экономически эффективного выявления устойчивости к классу резервных антибиотиков — карбапенемам. Эта устойчивость, как правило, совпадает с резистентностью к ряду других препаратов. Метод ольденбургских исследователей предполагает первоначальное тестирование чувствительности бактериального штамма к двум специфическим антибиотикам, которые, как показало исследование, являются особенно надежными индикаторами.

Во многих случаях результат этих тестов в сочетании со специально разработанным командой алгоритмом уже может определить, способен ли исследуемый бактериальный штамм разрушать антибиотик-карбапенем. Обладая этими знаниями, врачи могут при необходимости назначить другой препарат. Если результаты теста неясны, потребуется дополнительное тестирование, которое команда также описала в статье.

«Этот подход, безусловно, значительно быстрее и дешевле, чем текущие методы обнаружения этих резистентностей», — говорит профессор Хампрехт. Другим преимуществом, по его словам, является то, что большинство лабораторий уже имеют инфраструктуру для проведения этих тестов.

Резистентность штаммов Proteus mirabilis часто оставалась невыявленной в прошлом, поскольку она часто вызывается ферментами, на которые не проверяют в стандартных процедурах тестирования или большинстве методов молекулярной биологии.