Обнаружены новые цирковирусы у гринд и косаток в Северной Атлантике
Исследовательская группа обнаружила два ранее неизвестных цирковируса у короткоплавниковых гринд и косаток в Карибском регионе Северной Атлантического океана. Это первая находка цирковирусов китообразных в данном регионе, расширяющая известное разнообразие цирковирусов у морских позвоночных.
Исследование опубликовано в журнале Virology.
В работе участвовали студенты и старшие исследователи из Университета штата Аризона (ASU), Прибрежного университета Каролины, Университета Сьюэни (США), а также учёные из Сент-Винсента и Гренадин, Университета Вест-Индии (Барбадос), Кейптаунского университета (ЮАР) и Института Пастера (Франция).
Исследование под названием "Новые цирковирусы, идентифицированные у короткоплавниковой гринд и косатки в Северной Атлантике" (первый автор — Мэттью Де Кох) проводилось под руководством вирусолога Арвинда Варсани из ASU. Учёные использовали высокопроизводительное секвенирование для анализа архивных образцов тканей, собранных у погибших китов в рамках долгосрочного сотрудничества Рассела Филдинга (Прибрежный университет Каролины) с кустарными китобоями острова Сент-Винсент.
Было восстановлено семь полных геномов цирковирусов: пять — от короткоплавниковых гринд и два — от косаток. Эти вирусы представляют два новых вида, названные shofin circovirus и orcin circovirus. Оба вируса также отличаются от единственного ранее известного цирковируса китообразных — beaked whale circovirus, обнаруженного у выбросившегося на берег кита в Тихом океане.
Анализ капсидных белков выявил заметные изменения в поверхностно-экспонированных петлях (особенно в E-F петле), которая почти вдвое длиннее, чем у хорошо изученного porcine circovirus 2. Цирковирусы китообразных образуют отдельную, хорошо поддерживаемую монофилетическую кладу в пределах рода Circovirus. Авторы отмечают, что ограниченные доступные данные допускают возможность, что цирковирусы могли инфицировать предков китообразных на ранних этапах их эволюционной истории, однако для проверки этой гипотезы необходимы дополнительные данные секвенирования от большего числа таксонов.
Пути передачи и влияние цирковирусов на здоровье китообразных остаются неизвестными. В статье цитируется предыдущая работа по beaked whale circovirus, предполагавшая иммуносупрессию, что согласуется с известными эффектами цирковирусов у наземных млекопитающих и птиц. Однако авторы подчёркивают необходимость дальнейших исследований разнообразия, передачи и патогенности цирковирусов у китообразных.
