Анализ ДНК из окружающей среды позволил оценить популяцию китовых акул

Группа исследователей из Дании, Великобритании и Катара смогла оценить численность китовых акул в Персидском заливе, используя только ДНК окружающей среды (eDNA), найденную в пробах морской воды. В своей статье, опубликованной в журнале Nature Ecology & Evolution, команда описывает анализ проб воды, полученные данные и полезность такого подхода.

Китовые акулы — самые крупные рыбы в мире, питающиеся фильтрацией планктона. Чтобы изучить их, учёные собрали небольшие пробы океанской воды в местах их обитания. Затем они отфильтровали воду в поисках материала, содержащего eDNA акул: фекалий, мочи и частиц кожи. Секвенирование этого материала позволило получить много информации о локальной популяции.

Исследователи смогли:

• Рассчитать скорость мутаций ДНК у китовых акул, сравнив данные eDNA с ранее полученными образцами.
• На основе этого оценить вероятную численность популяции в локальной области (Персидский залив).
• Экстраполировать данные для оценки численности популяции во всём Индо-Тихоокеанском регионе.
• Установить, что китовые акулы Индо-Тихоокеанского региона генетически отличаются от акул, обитающих в Атлантическом океане.

Сбор и анализ eDNA стал полезным инструментом для исследований, так как не требует отлова животных для получения образцов ДНК. Это особенно важно для изучения исчезающих видов или видов, обитающих на обширных территориях, например, в открытом океане. Ранее метод использовали для обнаружения организмов в конкретной среде, но данное исследование впервые применило его для получения информации о виде в целом. Эти данные могут помочь в защите находящихся под угрозой исчезновения китовых акул.