Древние останки мамонтов сохранили самую старую в мире бактериальную ДНК, связанную с хозяином
Международная команда под руководством исследователей из Центра палеогенетики обнаружила микробную ДНК, сохранившуюся в останках шерстистого и степного мамонтов возрастом более миллиона лет. Анализ выявил одну из самых древних когда-либо восстановленных микробных ДНК, а также идентифицировал бактерии, которые, возможно, вызывали заболевания у мамонтов. Результаты опубликованы в журнале Cell.
Исследователи из Центра палеогенетики (совместный проект Стокгольмского университета и Шведского музея естественной истории) проанализировали микробную ДНК из 483 образцов мамонтов, 440 из которых были секвенированы впервые. Среди них был степной мамонт, живший около 1,1 миллиона лет назад. Используя передовые геномные и биоинформатические методы, команда смогла отличить микробы, которые жили вместе с мамонтами, от тех, которые попали в их останки после смерти.
Шесть микробных групп сохранялись во времени и пространстве
Анализ выявил шесть групп микробов, стабильно связанных с мамонтами-хозяевами, включая родственников Actinobacillus, Pasteurella, Streptococcus и Erysipelothrix. Некоторые из этих микробов могли быть патогенными.
Например, одна из обнаруженных бактерий, родственная Pasteurella, тесно связана с патогеном, вызывавшим смертельные вспышки у африканских слонов. Поскольку африканские и азиатские слоны — ближайшие живые родственники мамонтов, это открытие ставит вопрос о том, могли ли мамонты быть уязвимы к подобным инфекциям.
Примечательно, что команда восстановила частичные геномы Erysipelothrix из останков степного мамонта возрастом 1,1 миллиона лет. Это самая древняя из известных ДНК микробов, связанных с хозяином, что расширяет границы возможного в изучении взаимодействий древних хозяев и их микробиомов.
Новое окно в древние экосистемы
Хотя точное влияние выявленных микробов на здоровье мамонтов определить сложно из-за деградации ДНК и ограниченных сравнительных данных, исследование даёт беспрецедентное представление о микробиомах вымершей мегафауны. Результаты показывают, что некоторые микробные линии сосуществовали с мамонтами сотни тысяч лет, охватывая как широкие географические ареалы, так и эволюционные временные масштабы — от более миллиона лет назад до вымирания шерстистых мамонтов на острове Врангеля около 4000 лет назад.
