Ученые расшифровали генетические секреты финиковой пальмы

Исследователи из Weill Cornell Medical College в Катаре составили черновую версию генома финиковой пальмы, раскрыв многие ее генетические секреты.

"Мы сгенерировали черновую последовательность ДНК и первичную сборку генома финиковой пальмы, используя самые передовые технологии", — говорит Джоэл Малек, директор лаборатории геномики WCMC-Q. Эта генетическая информация крайне ценна для исследователей, работающих над улучшением урожайности и качества плодов, а также над пониманием восприимчивости и устойчивости к болезням.

Работа по секвенированию была исследованием для подтверждения концепции, целью которого была проверка возможностей основной лаборатории для крупномасштабных геномных проектов. Лаборатория является частью большой биомедицинской исследовательской программы, запущенной WCMC-Q при поддержке Qatar Foundation.

Для создания черновой карты исследователи использовали метод секвенирования нового поколения, который, по словам Малека, обеспечивает качество данных между методом EST (экспрессируемых меток последовательности) и традиционным методом полногеномного картирования. "Мы смогли получить относительно непредвзятое представление о генных регионах всего растения финиковой пальмы за гораздо меньшую стоимость и за более короткий срок. Используя этот подход, мы увеличили общедоступные знания о генах финиковой пальмы примерно в 1000 раз".

ДНК была получена из листьев финиковой пальмы, предоставленных Qatar Plant Tissue Culture Lab.

Финиковые пальмы играют значительную роль в сельском хозяйстве Ближнего Востока, Северной Африки и Пакистана. Плоды являются основным источником питания в этих регионах, а само дерево важно для развития устойчивого сельского хозяйства во многих засушливых и засоленных регионах мира.

Малек и его коллеги продолжат улучшать черновую последовательность и опубликуют данные, уже сделав информацию доступной для ученых по всему миру.