Расшифровка генома финиковой пальмы проливает свет на её происхождение

Исследователи из NYU Abu Dhabi создали карту генетических изменений в геноме финиковой пальмы и установили ключевые различия между ближневосточными и североафриканскими разновидностями.

В исследовании, опубликованном в Nature Communications, учёные из Центра геномики и системной биологии NYUAD идентифицировали более 7 миллионов мутаций (нуклеотидных полиморфизмов) между сортами. Также были обнаружены гены, потенциально важные для созревания плодов, их цвета и устойчивости к болезням.

Две гипотезы происхождения

Исследование предлагает два возможных сценария:

  1. Современные финиковые пальмы происходят от двух независимых событий одомашнивания — более раннего на Ближнем Востоке и более позднего в Северной Африке.
  2. Пальмы были впервые одомашнены на Ближнем Востоке, а затем распространились в Северную Африку, где скрестились со своим диким предком.

Масштаб исследования

Работа является частью проекта «100 Dates!» по секвенированию генома под руководством профессора Майкла Пуругганана. Команда проанализировала геном 62 сортов финиковой пальмы из 12 стран:

  • 36 образцов с Ближнего Востока
  • 17 — из Северной Африки
  • 9 — из Южной Азии

Археологические данные указывают, что одомашнивание началось в регионе Персидского залива (найдены семена возрастом более 7000 лет на о. Далма, Абу-Даби). В Северной Африке культурные финики появляются примерно на 3000 лет позже.

Ключевые открытия

  • Учёные обнаружили генетическую мутацию, отвечающую за цвет плодов (жёлтый или красный). Интересно, что такая же мутация есть у очень далёкого родственника — масличной пальмы, несмотря на 60 миллионов лет раздельной эволюции.
  • «Эта схожесть говорит о том, что эволюция использует одни и те же гены у разных видов для получения одинакового результата», — пояснил Майкл Пуругганан.
  • Идентификация дикого предка остаётся важной задачей, так как поможет понять генетические основы процесса одомашнивания.

Полученные данные могут помочь в селекции сортов с нужными свойствами, например, повышенной солеустойчивостью для выращивания в засушливых регионах.

Проект «100 Dates!» продолжается. Следующие этапы включают сбор большего числа образцов, картирование важных генов и сотрудничество с учёными из UAE University в Аль-Айне и Багдадского университета.