Полная геномная последовательность герпесвируса слонов 4 типа

Ученые из Медицинского колледжа Бейлора и Медицинской школы Джонса Хопкинса секвенировали полный геном Elephant Endotheliotropic Herpesvirus 4, известного как EEHV4(Baylor). Это выявило уникальные характеристики данного вида герпесвируса слонов, вызывающего смертельное заболевание у азиатских слонов как в условиях содержания под присмотром, так и в дикой природе.

Результаты опубликованы в текущем выпуске журнала mSphere Американского общества микробиологии.

"Смертельная форма болезни преимущественно связана с EEHV1, но более легкое заболевание вызывается EEHV5 или EEHV4, о которых известно меньше", — сказал доктор Пол Линг, доцент молекулярной вирусологии и микробиологии в Бейлоре. — "Здесь мы определили полную последовательность геномной ДНК вида EEHV4, полученного из смыва из хобота выжившего детеныша азиатского слона после перенесенного EEHV4".

Этот конкретный слоненок — часть наблюдаемого стада в Хьюстонском зоопарке, которое участвует в исследовательском сотрудничестве между зоопарком, Бейлором, Джонсом Хопкинсом и Национальным зоопарком в Вашингтоне по изучению EEHV. Команда разработала быстрый диагностический тест, позволяющий проводить регулярные скрининги крови и смывов из хобота.

Благодаря этим проверкам исследователи обнаружили, что некоторые слоны в стаде перенесли последовательные легкие инфекции, вызванные разными видами EEHV, включая EEHV4.

"Вероятно, стада в конечном итоге заражаются несколькими видами и подтипами EEHV, поэтому понимание молекулярного строения и изучение генетических взаимоотношений между разными видами предоставит информацию, которая может привести к контролю над болезнью", — сказал Линг.

Исследователи уже секвенировали EEHV1A, EEHV1B и EEHV5. Внутри EEHV4(Baylor) они обнаружили 25 новых или отсутствующих генов — некоторые присутствуют в EEHV4(Baylor), но не в других, а также гены, присутствующие в других, но отсутствующие в EEHV4(Baylor).

Еще одной выявленной особенностью было наличие 26 паралогичных (происходящих от одного гена) членов высокодивергентного семейства трансмембранных белков. Более подробное описание этих находок можно найти в сопровождающей рукописи, также опубликованной в mSphere.

Исследователи также смогли идентифицировать существование двух различных подтипов этого вида вируса, известных как EEHV4A и EEHV4B.

"Вокруг патогенности EEHV все еще остаются вопросы, требующие дополнительных исследований", — сказал доктор Гари С. Хейуорд из Медицинской школы Джонса Хопкинса. — "Как только различия в патогенезе многих видов и их соответствующих подтипов будут лучше поняты, детальное сравнение последовательностей и содержания генов всех типов геномов, надеемся, предоставит важную и полезную информацию для будущей диагностики, оценки и потенциальных подходов с вакцинами или противовирусными препаратами для диагностики, лечения и контроля заболеваний, связанных с EEHV".

Это второй полный геном EEHV, секвенированный этой группой; первым был EEHV1A (Кимба) в 2013 году.