Кажущиеся «сломанными» гены коронавирусов могут быть важны для выживания вируса

Геномы вирусов обычно минимальны и содержат только самые необходимые гены. Однако коронавирусы, включая SARS-CoV-2, имеют дополнительные «аксессуарные» гены, функция большинства которых неизвестна.

Исследователи из Университета здравоохранения штата Юта обнаружили, что некоторые из этих вирусных генов сохраняются в геноме, даже если они не производят рабочий белок, что является функцией подавляющего большинства генов. Их работа, опубликованная в Current Biology («Скрытые эволюционные ограничения диктуют сохранение аксессуарных генов коронавируса»), может помочь лучше прогнозировать, какие варианты вируса могут быть более опасными.

Ключевые наблюдения:

• Исследуя эволюцию мышиного коронавируса в реальном времени, учёные увидели, что один из аксессуарных генов сохранялся в геноме на протяжении многих поколений вирусов, хотя и перестал производить белок.
• Нечто похожее, вероятно, происходит и в SARS-CoV-2. Ген ORF8 присутствует в большинстве штаммов вируса, хотя в некоторых линиях производимый им белок крошечный и, предположительно, нефункционален.

Гипотеза и значение:

Исследователи полагают, что эти кажущиеся «сломанными» гены могут важным образом помогать контролировать активность других вирусных генов. Когда мышиный вирус терял другой аксессуарный ген, активность остальных генов менялась.

Как отмечает первый автор исследования Стивен Голдштейн, Ph.D., эти находки подчёркивают важность изучения не только белка, который производит ген, при попытке понять, какие вирусные варианты могут быть наиболее опасными: «Функция самой генетической последовательности — а не только функция белка — может влиять на приспособленность и передачу вируса с течением времени. Под поверхностью происходит другая эволюция, о которой мы мало знаем».