'Молекулярный GPS' предлагает детальные карты генов для ускорения разработки лекарств
Ученые Северо-Западного университета создали крупнейший в своем роде открытый ресурс, который поможет исследователям сократить на месяцы время ранней стадии разработки лекарств, позволяя лучше понять болезни и найти потенциальные методы лечения.
Платформа SOAR (Spatial transcriptOmics Analysis Resource) — это «единое окно», которое помогает ученым исследовать, как гены ведут себя по-разному в различных частях тела, показывает, как клетки могут общаться друг с другом, и позволяет находить новые возможности для лекарств.
Пространственная транскриптомика — это передовой научный метод, который помогает исследователям видеть, какие гены активны в разных частях ткани, давая ученым общую картину клеточных взаимодействий. SOAR — это первый комплексный ресурс по пространственной транскриптомике, созданный специально для ускорения процессов открытия лекарств.
«Слишком дорого и слишком долго продвигать тысячи потенциальных кандидатов в лекарства к доклиническим исследованиям и клиническим испытаниям, — сказал автор-корреспондент Юань Луо. — Нам нужно выбрать правильные лидеры, а затем продвигать их в последующие исследования. Этот ресурс поможет расставить приоритеты».
Результаты исследований с использованием ресурса были опубликованы в Science Advances. По словам Луо, несколько фармацевтических компаний уже рассматривают возможность использования SOAR в своих исследованиях.
Дает исследователям «молекулярный GPS»
SOAR объединяет данные 441 набора данных пространственной транскриптомики от 19 различных компаний, позволяя исследователям видеть детальные карты активности генов в 3461 образце тканей от 13 видов (от человека до рыбки данио) и 42 типов тканей (например, грудь, легкие, мозг, кишечник и т.д.).
Показывая, как гены экспрессируются — включаются или выключаются — в разных частях ткани, и связывая это с тем, как определенные химические вещества влияют на клетки, этот набор данных действует как «молекулярный GPS», помогая ученым точно определить биологические процессы, на которые можно воздействовать для лечения болезней.
От СРК до рака груди
При заболевании, по словам Луо, часто проблема не в самой клеточной активности, а в том, где эта активность происходит.
«Если иммунные клетки атакуют нормальные клетки в обычной ткани, это очень плохо, потому что это может привести к воспалительному заболеванию, например, синдрому раздраженного кишечника, — сказал Луо. — Или если иммунные клетки не атакуют раковые клетки в микроокружении опухоли, это тоже очень плохо, потому что позволяет раку расти. SOAR помогает изучить изменчивость и взаимодействия, чтобы дать исследователям понимание того, какой механизм работает, чтобы они могли лучше понять, что лежит в основе болезни».