Ключевые мутации в варианте «Альфа» позволяют SARS-CoV-2 преодолевать эволюционные слабые места

Удаление двух аминокислот H69/V70 в спайк-белке, одна из ключевых мутаций в «альфа-варианте» SARS-CoV-2, позволяет вирусу преодолевать уязвимости по мере его эволюции.

Мутация, возникшая независимо

Исследователи впервые наблюдали эту мутацию в конце 2020 года у иммунокомпрометированного пациента. Позже она была обнаружена в варианте B.1.1.7 («Альфа»), который привел к строгому локдауну в Великобритании. Анализ показал, что делеция H69/V70 присутствует в более чем 600 000 геномных последовательностей SARS-CoV-2 по всему миру и независимо возникала и распространялась несколько раз, особенно в Европе, Африке и Азии.

Механизм действия: компенсация слабостей

Используя псевдовирус, несущий спайк-белок с делецией H69/V70, ученые установили:

  • Мутация не позволяет вирусу ускользать от нейтрализующих антител, выработанных после вакцинации или перенесенной инфекции.
  • Она делает вирус вдвое более инфекционным по сравнению с доминировавшим в 2020 году штаммом.
  • Причина — увеличение количества зрелых спайк-белков на поверхности вирусных частиц.

Эволюционное преимущество

Мутация H69/V70 действует как эволюционный компенсатор. Она помогает вирусу нивелировать негативные эффекты других мутаций (например, тех, что позволяют ускользать от иммунного ответа), которые в ином случае могли бы ухудшить его способность к репликации.

«Делеция позволила этим вариантам "и съесть пирог, и сохранить его" — они стали лучше ускользать от иммунитета и более инфекционными», — пояснил профессор Рави Гупта, старший автор исследования.

Это открытие важно для прогнозирования поведения новых вариантов вируса и раннего внедрения стратегий общественного здравоохранения.