Быстрое появление новых вариантов SARS-CoV-2 из-за способности вируса временно ускорять эволюцию
Новое исследование под руководством Института Доэрти показало, что вирус SARS-CoV-2 обладает способностью временно ускорять темпы своей эволюции, что позволяет вариантам появляться быстрее, чем у других вирусов.
Как сообщается в статье, опубликованной в Molecular Biology and Evolution, команда под руководством доктора Себастьяна Дюшена из Мельбурнского университета обнаружила, что вирус, вызывающий COVID-19, проходит через кратковременные всплески мутаций, а затем возвращается к своей «нормальной» скорости.
Обычно все вирусы мутируют с довольно постоянной скоростью, и большинству требуется год или более для развития нового варианта.
«Однако мы наблюдали, что варианты SARS-CoV-2, особенно вызывающие озабоченность, претерпели гораздо больше мутаций, чем можно было бы ожидать при нормальном эволюционном темпе у схожих коронавирусов», — пояснил доктор Дюшен.
«Например, вариант Дельта появился всего за шесть недель от своей исходной формы».
Чтобы понять причину, лаборатория доктора Дюшена провела вычислительный анализ сотен геномных последовательностей штаммов SARS-CoV-2. Исследование было сосредоточено на первых четырёх вариантах, вызывающих озабоченность: Альфа, Бета, Гамма и Дельта.
«Изначально считалось, что SARS-CoV-2 в целом увеличил скорость эволюции, но на самом деле именно способность вируса временно увеличивать свою скорость вызывает разницу в темпах», — сказал доктор Дюшен. — «Это как если бы кто-то нажал на педаль газа в автомобиле».
По словам учёного, эти всплески могут быть вызваны рядом факторов, включая:
- Продолжительные инфекции у отдельных людей.
- Сильный естественный отбор, позволяющий вирусу «предпочитать» ускользание от иммунного ответа.
- Повышенная трансмиссивность в условиях невакцинированных популяций, что позволяет вирусу быстро распространяться и эволюционировать.
Это открытие подчеркивает важность продолжения геномного надзора для раннего обнаружения новых вариантов.
«Поскольку этот вирус развивается так быстро, раннее обнаружение имеет первостепенное значение для нашего мониторинга и реагирования», — заявил доктор Дюшен.
Он также подчеркнул необходимость увеличения охвата вакцинацией: «Всё, что мы можем сделать для уменьшения количества вируса в популяции, поможет снизить вероятность появления новых вариантов».
В команду исследователей вошли доктор Аш Портер и доктор Виттамма Вирт из Института Доэрти, а также магистрант Мельбурнского университета Джон Тэй.