Типирование

Типирование — это группа технических приемов, используемых для определения внутривидовых категорий микроорганизмов, таких как:

• Серовар (различается по антигенной структуре),
• Хемовар (различается по биохимическим свойствам),
• Фаговар (различается по чувствительности к бактериофагам),
• Бактериоциновар (различается по способности продуцировать или быть чувствительным к бактериоцинам),
• Биовар (биологический вариант),
• Резистенсвар (различается по устойчивости к антибиотикам или другим веществам),
• Форма и другие.

Метод основан на существующей гетерогенности (разнородности) бактериальных популяций по указанным признакам. Типирование применяют в эпидемиологии с целью установления источников инфекции и путей передачи возбудителя.

Для корректного типирования необходимо использовать унифицированные схемы, стандартные типовые фаги, бактериоциногенные штаммы, питательные среды, антибиотики или другие препараты, типовые сыворотки, а также строго соблюдать предложенный технологический регламент исследования.

См. также: Фаготипирование, Бактериоцинотипирование.

Современный контекст

Сегодня методы типирования, особенно основанные на анализе нуклеиновых кислот (ПЦР, секвенирование, MLST — мультилокусное типирование последовательностей, анализ полногеномных последовательностей — WGS), вытесняют или дополняют многие классические фенотипические подходы. Молекулярное типирование обеспечивает более высокую разрешающую способность, воспроизводимость и позволяет проводить точный эпидемиологический анализ и отслеживание вспышек инфекционных заболеваний. Однако традиционные методы (серотипирование, фаготипирование) по-прежнему остаются важными для рутинной диагностики и эпидемиологического надзора за некоторыми патогенами (например, Salmonella spp., Escherichia coli).