Защита рептилий и амфибий Австралии с глобальным значением
Экосистемы по всему миру зависят от рептилий и амфибий. Они играют ключевую роль в пищевой сети — как хищники и добыча — а иногда и в опылении и распространении семян. Лягушки служат хорошим индикатором здоровья экосистемы из-за их чувствительности к изменениям окружающей среды. По мере глобальных изменений среды популяции лягушек быстро сокращаются, а виды рептилий и амфибий находятся под угрозой.
Bioplatforms Australia профинансировала создание геномного ресурса для лучшего понимания и защиты уникальных рептилий и амфибий Австралии. Австралийскую инициативу по геномике амфибий и рептилий возглавляют представители австралийских музеев, университетов и государственных учреждений.
Хотя проект сосредоточен на Австралии, уникальность изучаемых видов делает его чрезвычайно значимым и интересным для международного научного сообщества. Многие исследователи по всему миру обращаются к австралийским видам как к образцовым примерам явлений, центральных для их исследований, которые не встречаются больше нигде.
«В Австралии самое большое разнообразие ящериц на планете и глобально уникальные семейства лягушек и рептилий, унаследованные от Гондваны, — сказал профессор Крейг Мориц из Австралийского национального университета. — У нас также самый сухой континент в мире, и наши лягушки и ящерицы выработали важные адаптации в ответ на это. Понимание того, как австралийские лягушки и рептилии реагировали на новые среды в прошлом, улучшит наше понимание их способности реагировать на ускоряющиеся изменения в будущем».
Генеральный директор Bioplatforms Australia Эндрю Гилберт заявил: «Этот проект ускорит фундаментальные исследования в области геномики рептилий и амфибий и в тех областях, где Австралия внесет положительный вклад в глобальные исследовательские усилия. Создание этого ресурса обеспечит устойчивость инициативы после окончания инвестиций Bioplatforms».
Научное сообщество, участвующее в проекте, ставит целью отсеквенировать, аннотировать, физически картировать и сделать общедоступными (по принципам FAIR) черновые последовательности геномов с использованием новейших технологий, а также проведет сопутствующие исследования для решения существенных научных вопросов. Государственные департаменты, зоопарки и другие учреждения с центрами разведения, неправительственные организации и общественные группы будут использовать геномные ресурсы, созданные в рамках этой инициативы, или сотрудничать с исследователями для достижения своих целей в области сохранения и управления.
«Эта программа целевой геномики, включающая de-novo сборку/аннотацию генома, филогеномику и геномику сохранения, опирается на опыт предыдущих инвестиций Bioplatforms», — сказал Гилберт.
«Геномика играет центральную роль в углублении понимания того, как виды могут быстро реагировать на экологические проблемы, будь то климат, болезни или изменение среды обитания, — заявил выдающийся профессор Артур Жорж из Университета Канберры. — Австралийские рептилии и амфибии, благодаря своему разнообразию и тому, как они адаптировались к уникальным австралийским вызовам прошлого, предоставляют беспрецедентную возможность объединить геномику с более традиционными подходами, чтобы лучше информировать управление и сохранение этой особой группы животных», — добавила доктор Джейн Мелвилл, старший куратор герпетологии в Музеях Виктории.
Инициатива по геномике амфибий и рептилий будет тесно сотрудничать с национальными центрами вычислений и хранения данных (National Computational Infrastructure, Australian Research Data Commons, AaRNET), использовать новейшие биоинформатические конвейеры для сборки и аннотации (BioCommons), что позволит быстро и широко распространять генерируемые данные, и привлекать специализированную экспертизу секвенирующих центров Bioplatforms. Команда также имеет совместные отношения с проектами Genome 10K, Vertebrate Genome Project и Earth BioGenome Project для расширения международных связей.
Различные проекты, финансируемые ARC, также будут напрямую связаны с Инициативой — через внутреннее и международное сотрудничество или связи с различными партнерами в области сохранения и управления, а также с другими заинтересованными сторонами.