Исследование разнообразия бактерий E. coli у госпитализированных пациентов
Escherichia coli — одна из бактерий, обитающих в кишечной микробиоте человека. Хотя обычно она выполняет полезные функции, некоторые её штаммы патогенны и могут вызывать инфекции, например, мочевыводящих путей (ИМП).
Исследователи из Федерального университета Сан-Паулу (Бразилия) изучили вирулентность и устойчивость к антибиотикам штаммов E. coli, связанных с ИМП у госпитализированных пациентов.
Ключевые выводы исследования
- Эндогенный характер инфекций: Более чем у 70% пациентов ИМП оказались эндогенными, то есть вызванными бактериями из их собственной кишечной микробиоты.
- Генетическое разнообразие: Кишечная микробиота пациентов содержала как минимум две генетически разные популяции E. coli.
- Необычные штаммы: Около 30% пациентов были колонизированы неферментирующими лактозу штаммами E. coli, которые встречаются реже. У некоторых пациентов в микробиоте были только такие штаммы.
- Колонизация патогенами: В кишечной микробиоте всех пациентов были обнаружены бактерии, обладающие всеми генетическими маркерами, необходимыми для классификации как патогенные, даже если инфекция ещё не развилась.
- Устойчивость к антибиотикам: У всех пациентов, чья микробиота была колонизирована лекарственно-устойчивыми бактериями, те же бактерии вызывали и эндогенные ИМП. Отмечена устойчивость к цефалоспоринам третьего поколения и колистину, что ВОЗ считает критической угрозой для глобального здравоохранения.
- Глобальные клоны: С помощью анализа геномов исследователи выявили так называемые «глобальные клоны риска». Один из клонов, найденный у двух пациентов, был идентичен штаммам, выделенным при ИМП в Бразилии, США, Европе и Азии.
Значение исследования
Ранняя оценка состава кишечной микробиоты у госпитализированных пациентов (по крайней мере, в случаях с E. coli) может помочь:
- Направить и облегчить лечение.
- Выявить пациентов с риском развития внекишечных инфекций, таких как ИМП.
- Предотвратить распространение бактерий среди других пациентов в больнице.
Наличие в микробиоте человека устойчивых к лекарствам вирулентных бактерий вызывает серьёзную озабоченность, поскольку они могут распространяться и за пределы больничной среды.