Ученые сократили время идентификации сальмонеллы
Исследователи из Корнеллского университета, Глобального центра безопасности пищевых продуктов Mars в Пекине и Университета Джорджии разработали метод, позволяющий провести полногеномное секвенирование для определения серотипа сальмонеллы всего за два часа, а весь процесс идентификации — в течение восьми часов.
Определение серотипа сальмонеллы упрощает для специалистов по безопасности пищевых продуктов поиск источника бактериального заражения, которое может произойти в самых разных продуктах: фруктах, овощах, орехах, мясе, крупах, детских смесях и кормах для животных.
«Поскольку цепочка поставок продуктов питания становится все более глобальной и взаимосвязанной, возможность заражения пищи сальмонеллой возрастает», — заявила ведущий автор исследования Силинь Тан, старший научный сотрудник по управлению микробиологическими рисками в Глобальном центре безопасности пищевых продуктов Mars в Китае. — «В быстро меняющемся мире пищевого производства, где критически важны быстрая идентификация и реагирование на случаи заражения сальмонеллой, разработка более эффективного метода идентификации патогенов необходима».
По словам Тан, традиционное серотипирование было основой мониторинга общественного здоровья в отношении инфекций сальмонеллы на протяжении полувека. Однако длительное время выполнения, высокая стоимость и сложная подготовка проб заставили мировых регуляторов безопасности пищевых продуктов, пищевые власти и агентства общественного здравоохранения перейти на методы полногеномного секвенирования для субтипирования патогенов.
Все 38 штаммов сальмонеллы — представляющих 34 серотипа — оцененные в этом исследовании, были точно предсказаны на уровне серотипа с использованием полногеномного секвенирования.
Это важная новость для пищевой промышленности, поскольку классическое серотипирование могут проводить очень немногие лаборатории, отметил Мартин Видманн, профессор по безопасности пищевых продуктов и научный сотрудник Института пищевых систем Корнелла.
«В некоторых странах, — сказал Видманн, — может потребоваться до двух дней, чтобы просто доставить подозреваемую сальмонеллу в сертифицированную лабораторию».
По его словам, новый современный тест на основе полногеномного секвенирования использует простое оборудование. «Для пищевой промышленности перерабатывающие заводы часто находятся вдали от центров. Теперь тестирование можно проводить в лаборатории, которая находится близко к пищевому предприятию».