Печёночный паразит лишён ключевых генов для синтеза жирных кислот: Секвенирование генома Clonorchis sinensis

Печёночный сосальщик человека Clonorchis sinensis поражает более 35 миллионов человек в Юго-Восточной Азии и 15 миллионов в Китае. Инфекция вызывает клонорхоз. Повторное или хроническое заражение может привести к серьёзным заболеваниям печени, желчного пузыря или желчных протоков, включая часто смертельный рак желчных протоков — холангиокарциному (CCA). Полная последовательность генома C. sinensis, опубликованная в журнале открытого доступа Genome Biology, позволила понять доступные паразиту биохимические пути и показала отсутствие ферментов, необходимых для биосинтеза жирных кислот.

C. sinensis имеет сложный жизненный цикл. Яйца плавают в пресной воде, пока их не съест улитка. Внутри улитки они развиваются до свободно плавающей стадии. Эти личинки выходят из улитки и внедряются в рыбу, покрываясь кислотоустойчивой оболочкой. Люди и другие млекопитающие заражаются, употребляя в пищу сырую рыбу. Попав в тонкий кишечник, сосальщики мигрируют в желчные протоки печени, где живут всю взрослую жизнь.

В геноме размером 516 Мб было обнаружено более 16 250 генов (для сравнения, в геноме человека около 23 000 генов на 3 Гб ДНК). Были найдены гены энергетического метаболизма — как аэробного (используемого молодыми особями), так и анаэробного (используемого взрослыми). Хотя гены, кодирующие белки, необходимые для метаболизма жирных кислот, присутствовали, ключевые ферменты для их синтеза отсутствовали.

Профессор Синьбин Ю, руководивший исследованием, пояснил: «Два других печёночных сосальщика, S. japonicum и S. mansoni, также лишены этих ферментов. Это означает, что печёночные сосальщики эволюционировали, чтобы использовать жирные кислоты хозяина ещё до разделения видов». Профессор Ю заключает: «Геномная информация не только помогает понять эволюцию, но и последовательность C. sinensis помогает понять биологию печёночного сосальщика. Это, в свою очередь, поможет найти новые способы борьбы с вызываемыми им болезнями или новые мишени для создания вакцины».