Исследование впервые изучило микробиом спермы с помощью РНК-секвенирования

Новое совместное исследование команды из Медицинской школы Университета Уэйн Стейт, Центра фертильности CReATe и Университета Массачусетса в Амхерсте впервые детально изучило микробиом человеческой спермы с использованием РНК-секвенирования, обладающего достаточной чувствительностью для выявления контаминации и патогенной бактериальной колонизации.

Исследование "What human sperm RNA-Seq tells us about the microbiome", опубликованное в Journal of Assisted Reproduction and Genetics, ставило целью определить, могут ли данные РНК-секвенирования спермы человека служить чувствительным методом обнаружения микроорганизмов (бактерий, вирусов, архей) по сравнению с текущими методами целевого культивирования.

Методология и ключевое открытие

  • Ученые собрали 85 образцов семенной жидкости, выделили из них РНК сперматозоидов и провели её секвенирование.
  • Анализ данных, обычно отбрасываемых при рутинном секвенировании, позволил получить профиль микроорганизмов.
  • В одном образце было обнаружено аномально высокое количество микробных последовательностей. При детальном изучении в нём выявлено значительное количество бактерий Streptococcus agalactiae.

Значение и перспективы

  • Streptococcus agalactiae — ведущая причина неонатальных инфекций во время беременности и после родов, связанная со значительной смертностью при преждевременных родах, а также опасная для жизни взрослых, особенно пожилых людей.
  • Текущий стандартный метод анализа микробиома мужских репродуктивных путей (культивирование образцов) ограничен, так как большинство патогенов не растут в культуре.
  • Стоимость РНК-секвенирования резко снизилась, что делает этот метод доступным для получения более полной картины микробиома.
  • Как отметил ведущий автор Стивен Кравиц, нецелевое РНК-секвенирование спермы человека обладает повышенной чувствительностью и специфичностью и в будущем может стать полезным диагностическим инструментом для оценки микробного статуса в рамках персонализированного подхода к фертильности и здоровью.