Создан национальный атлас для опасной бактерии Listeria monocytogenes

Пищевые учёные из Корнеллского университета разработали новый инструмент геномного и географического картирования, который поможет отслеживать Listeria monocytogenes — один из самых смертоносных патогенов пищевого происхождения — при расследованиях и отзыве продуктов.

Национальный атлас покажет учёным, где в пределах континентальной части США обитают листерии и родственные виды. Это позволит точнее определять источники заражения в ингредиентах, на пищевых производствах и в готовой продукции. Исследование опубликовано 15 июля в Nature Microbiology.

«Наша группа создала более систематический способ оценки того, как часто разные листерии встречаются в разных местах», — сказал старший автор Мартин Видманн.

Listeria monocytogenes в продуктах может вызывать тяжёлые заболевания. По оценкам CDC, ежегодно в США регистрируется 1600 случаев листериоза, из которых около 260 заканчиваются летальным исходом.

Зная, что листерии естественным образом встречаются в почве, исследователи собрали сотни образцов почвы из малонарушенных природных зон, таких как заповедные территории парков.

На основе этих образцов был создан общенациональный атлас, включающий 1854 изолята листерий, представляющих 594 штамма и 12 семейств бактерий (филогрупп).

Основные факторы, влияющие на распространение бактерии:

«Целью этой работы был систематический сбор образцов почвы по всей территории США, чтобы зафиксировать истинное крупномасштабное пространственное распределение, геномное разнообразие и популяционную структуру видов листерий в естественной среде», — пояснила ведущий автор Цзинцю Ляо.

Исследование, использующее полногеномное секвенирование, поможет в будущих популяционно-геномных исследованиях и может принести пользу пищевой промышленности.

«Зная геномную информацию изолятов листерий и их возможное распространение по США, мы можем сузить происхождение до конкретного региона. Эту информацию можно использовать почти как прослеживаемость», — отметил Видманн.