Исследование микробиома сумчатых: как волонтёры по всей Австралии помогают собирать образцы

Исследовательница, которую муж в шутку называет «Доктор Какашка», посвятила 3,5 года изучению кишечных бактерий и здоровья сумчатых. Её интерес победил первоначальные предложения супруга изучать морских черепах или дюгоней в тёплом климате.

Отряд по сбору образцов

Для сбора помёта диких и содержащихся в неволе животных — восточных серых кенгуру, болотных и красношеих валлаби, голоносых вомбатов, а также кольцехвостых и кузу — была создана группа из около 20 волонтёров. В основном это работники приютов для дикой природы.

Каждый сезон они в любую погоду собирали свежие образцы с помощью пинцетов и zip-пакетов, заполняли документацию, маркировали и хранили образцы в морозильниках. Затем образцы отправлялись в университет в специальной термоупаковке для генетического анализа.

Цель — установить базовые показатели нормального дикого микробиома кишечника у разных животных в разных регионах и в разное время года. Это позволяет выявлять дисбаланс у животных в неволе и корректировать его через диету или добавки.

Необычные волонтёры

Для общения с волонтёрами была создана группа в Facebook «Marsupial Microbiome Poop Troop» с колоритными участниками:

• Кейт собирает самый свежий помёт вомбатов, выслеживая их в заповеднике, пока они не «произведут товар».
• Дэррил был опустошён не из-за разрушенного штормом дома, а потому, что его коллекция помёта опоссумов растаяла из-за двухнедельного отключения электричества, и пришлось начинать заново.
• Джули — самый активный сборщик, чьи крупные посылки с образцами разных видов не всегда радуют сотрудника университетского склада с обострённым обонянием.

Спасение осиротевших детёнышей

Исследование имеет серьёзную практическую цель — повысить выживаемость осиротевших детёнышей сумчатых (джоуи), чьи матери погибли под колёсами машин, от нападений собак или по другим причинам.

Микробиом кишечника таких крошечных джоуи по уровню развития сравним с микробиомом недоношенных человеческих младенцев. В норме он формируется в критический период через материнское молоко, условия в сумке, чистку и уход.

Внезапная потеря материнской заботы, стресс от неволи и полная смена диеты могут серьёзно нарушить микробиоту. Это делает джоуи уязвимыми к инфекциям, диарее и обезвоживанию, что часто приводит к гибели.

Возможность исправить этот дисбаланс повысит успешность выхаживания осиротевших сумчатых и увеличит число особей, которых можно вернуть в дикую природу. Принципы, отработанные на «обычных» видах, в дальнейшем могут быть применены к исчезающим видам в программах разведения в неволе.

Без помощи волонтёров «Отряда» было бы невозможно собрать такое количество и разнообразие образцов. Оставшиеся образцы будут храниться в замороженном виде для будущих исследований, так что усилия этих людей вносят реальный вклад в науку, который будет помогать дикой природе и впредь.